210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0522 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0522  transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  643    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  39.94 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5885  DeoR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 326 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4826  DeoR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 326 aa  202  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.658414  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  36.89 
 
 		 694 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  35.05 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  36.25 
 
 		 694 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  34.63 
 
 		 700 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  36.04 
 
 		 695 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 315 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  27.71 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  27.39 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.07 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  28.33 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.39 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  27.39 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.39 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.39 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.39 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.07 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 310 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 310 aa  129  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  26.42 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  26.98 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  27.04 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  27.1 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  27.1 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  25.32 
 
 		 319 aa  126  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 312 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  27.04 
 
 		 313 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  27.04 
 
 		 362 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  26.79 
 
 		 310 aa  125  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  26.73 
 
 		 310 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  28.91 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 310 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0550  transcriptional regulator  30 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29950  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  31.46 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3043  DeoR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  27.69 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  28.53 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  24.69 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  26.58 
 
 		 334 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  22.68 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3585  hypothetical protein  27.53 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0184789  normal  0.871841 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  27.22 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  30.23 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  22.47 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  26.62 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2565  DeoR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 336 aa  110  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2573  putative sugar-binding region  29.47 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  26.96 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  27.42 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  27.04 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0532  transcriptional regulator  28.76 
 
 		 324 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 316 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  26.77 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  26.77 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  26.77 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  26.77 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  24.12 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  26.77 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  26.77 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  26.77 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  27.8 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  27.48 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2797  transcriptional regulator, DeoR family  28.43 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  24.84 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03820  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  31.06 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3422  transcriptional regulator, DeoR family  32.19 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00167672  hitchhiker  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  26.9 
 
 		 325 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  24.84 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  24.84 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  27.65 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 339 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  22.52 
 
 		 321 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  27.1 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  27.1 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  27.1 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 363 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0643  DeoR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>