204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03820 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03820  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  100 
 
 		 318 aa  616  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  28.39 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  33.44 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  26.98 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  28.21 
 
 		 315 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  28.21 
 
 		 315 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  28.21 
 
 		 315 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  28.21 
 
 		 315 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  28.21 
 
 		 315 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  28.34 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  28.03 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  28.03 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 315 aa  135  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  27.56 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  24.14 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  26.9 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 363 aa  132  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  33.13 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  32.29 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  31.86 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  24.36 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  31.03 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2573  putative sugar-binding region  32.17 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  31.03 
 
 		 319 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 357 aa  122  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  28.35 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  29.58 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  28.25 
 
 		 321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 333 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2790  DeoR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 306 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2834  DeoR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 306 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2817  DeoR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 306 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0275474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  29.26 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  27.65 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  31.82 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  31.82 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06255  deoxyribonucleoside regulator/dihydroxyacetone kinase  32.03 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  28.89 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  31.82 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000492  transcriptional regulator  31.23 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  31.82 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  31.82 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3288  transcriptional regulator, DeoR family  34.27 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal  0.0190392 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  31.82 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3997  transcriptional regulator, DeoR family  35.39 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  31.82 
 
 		 694 aa  116  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  28.89 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  27.33 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  31.17 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  27.33 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3606  DeoR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5338  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  30 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2156  transcriptional regulator, DeoR family  28.98 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 341 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  28.39 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2797  transcriptional regulator, DeoR family  32.35 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  31.17 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  29.14 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  22.67 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5157  transcriptional regulator, DeoR family  30.25 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 334 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  25.57 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  25.57 
 
 		 310 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  28.39 
 
 		 328 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  25.57 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 322 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4738  DeoR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 339 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  30.23 
 
 		 694 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  25.57 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4358  DeoR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4444  DeoR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0599387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  29.45 
 
 		 700 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  25.48 
 
 		 310 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  27.44 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1988  transcriptional regulator, DeoR family  29.19 
 
 		 324 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000190118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  27.44 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  27.44 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  27.44 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  27.44 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0522  transcriptional regulator  31.77 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>