223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3537 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
323 aa  642    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  70.38 
 
 
331 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  71.8 
 
 
306 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  62.93 
 
 
319 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  62.93 
 
 
319 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  62.93 
 
 
319 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  62.93 
 
 
319 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  62.62 
 
 
319 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  63.64 
 
 
317 aa  411  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  63.64 
 
 
317 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  63.64 
 
 
317 aa  411  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  63.64 
 
 
317 aa  411  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  63.32 
 
 
317 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  63.64 
 
 
317 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  59.34 
 
 
319 aa  383  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  42.23 
 
 
312 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  42.23 
 
 
312 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  38.56 
 
 
315 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
310 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 
310 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  37.58 
 
 
310 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  37.42 
 
 
316 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  37.58 
 
 
310 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  37.25 
 
 
310 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  37.91 
 
 
313 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  37.91 
 
 
362 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  37.25 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  34.5 
 
 
323 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  33.55 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  33.12 
 
 
321 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  32.38 
 
 
319 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
320 aa  145  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1726  DeoR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
317 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0090  operon regulator SmoC  33.23 
 
 
317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0568695  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  32.69 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  27.51 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3776  DeoR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
313 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
345 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  31.73 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2565  DeoR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0728  putative transcriptional regulator  32.15 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1680  DeoR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
317 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388051  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
307 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  32.46 
 
 
700 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3240  transcriptional regulator, DeoR family  31.51 
 
 
333 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  31.72 
 
 
694 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  28.26 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0701  transcriptional regulator, putative  32.08 
 
 
339 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  31.8 
 
 
694 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0710  DeoR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
335 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0415966  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0496  DeoR family transcriptional regulator  31.83 
 
 
322 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.858474  hitchhiker  0.000586642 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2127  putative transcriptional regulator (repressor) transcription regulator protein  31.41 
 
 
315 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  32.48 
 
 
325 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0632  DeoR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
318 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  28.79 
 
 
333 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  32.17 
 
 
325 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  25.32 
 
 
315 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
333 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
326 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  32.63 
 
 
334 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0342  transcriptional regulator, putative  31.76 
 
 
315 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
317 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1045  putative transcriptional regulator  31.45 
 
 
315 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  31.96 
 
 
317 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0641  putative transcriptional regulator  31.45 
 
 
315 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2476  putative transcriptional regulator  31.45 
 
 
315 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.528896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0883  putative transcriptional regulator  31.45 
 
 
315 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300696  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0886  putative transcriptional regulator  31.45 
 
 
315 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0089  putative transcriptional regulator  31.45 
 
 
315 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156043  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  30 
 
 
339 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  30 
 
 
339 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  30 
 
 
339 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  30 
 
 
339 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  30 
 
 
339 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
316 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2635  DeoR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
340 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0867  erythritol transcriptional regulator  30.31 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2506  DeoR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
345 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140537  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  31.91 
 
 
695 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1661  DeoR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
345 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  31.43 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
339 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  29.69 
 
 
339 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  29.69 
 
 
339 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  27.76 
 
 
363 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1977  DeoR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
337 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2587  DeoR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
337 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2611  DeoR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.682873  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  31.86 
 
 
315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  29.22 
 
 
332 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02313  putative transcriptional regulator  27.1 
 
 
318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00764074  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5918  DeoR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  31.19 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
322 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  28.7 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2217  sugar-binding domain-containing protein  29.75 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0880863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  31.55 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1923  DeoR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>