223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3016 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 310 aa  637    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  97.74 
 
 		 310 aa  625  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  97.42 
 
 		 315 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  96.45 
 
 		 313 aa  617  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  96.77 
 
 		 310 aa  620  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  96.45 
 
 		 362 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  96.13 
 
 		 310 aa  616  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  96.13 
 
 		 310 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  95.48 
 
 		 316 aa  615  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  88.06 
 
 		 310 aa  568  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 312 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  38.49 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  38.49 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  38.49 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  38.49 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.853311 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  38.49 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  37.29 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  35.79 
 
 		 319 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  35.79 
 
 		 319 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  35.79 
 
 		 319 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  35.79 
 
 		 319 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  35.79 
 
 		 319 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  35.14 
 
 		 319 aa  176  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  34.73 
 
 		 317 aa  172  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  33.23 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  32.38 
 
 		 316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  31.29 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  30.39 
 
 		 321 aa  152  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 320 aa  153  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  29.74 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  30.19 
 
 		 694 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 345 aa  145  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2565  DeoR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  29.21 
 
 		 700 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  28.03 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  29.03 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  30.06 
 
 		 694 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  27.53 
 
 		 333 aa  138  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 333 aa  138  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  29 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  28.85 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  28.1 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  30.91 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 339 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  26.2 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  29.81 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0867  erythritol transcriptional regulator  28.43 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  30.7 
 
 		 316 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  26.45 
 
 		 338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  30.91 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  27.94 
 
 		 695 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  29.68 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  29.68 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 314 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1661  DeoR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  25 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4174  DeoR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  25.97 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  25.73 
 
 		 334 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390293 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  25.08 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  27.83 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  25.9 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.39 
 
 		 315 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.51 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  27.51 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  27.51 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.51 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.51 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.51 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  29.39 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.39 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 326 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2643  transcriptional regulator, DeoR family  28.48 
 
 		 314 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000047791  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1900  transcriptional regulator, DeoR family protein  27.96 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  29.39 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0522  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3776  DeoR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  29.39 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0532  transcriptional regulator  26.77 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0632  DeoR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289497  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  28.9 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5885  DeoR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 326 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2359  DeoR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  29.32 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>