214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3997 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3997  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 312 aa  604  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2797  transcriptional regulator, DeoR family  49.67 
 
 		 315 aa  267  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1461  transcriptional regulator, DeoR family  42.57 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2790  DeoR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2834  DeoR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2817  DeoR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0275474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0304  transcriptional regulator, DeoR family  44.44 
 
 		 324 aa  203  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1639  DeoR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 325 aa  155  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294849  hitchhiker  0.00400864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3263  DeoR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0573  transcriptional regulator, DeoR family  36.3 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 		 317 aa  125  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  28.9 
 
 		 328 aa  119  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  25.57 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 322 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  30.99 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  29.32 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  27.45 
 
 		 319 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  27.45 
 
 		 323 aa  112  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 323 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  29.07 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  28.34 
 
 		 332 aa  109  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  29.41 
 
 		 316 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  27.74 
 
 		 321 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 314 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2156  transcriptional regulator, DeoR family  27.74 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  28.34 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  29.35 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  29.35 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  32.03 
 
 		 694 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 335 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03820  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  35.39 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  28.21 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  27.71 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  25.8 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  22.64 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  27.54 
 
 		 339 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  27.54 
 
 		 339 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  27.54 
 
 		 339 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  27.54 
 
 		 339 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  27.54 
 
 		 339 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3426  transcriptional regulator, DeoR family  31.94 
 
 		 336 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  hitchhiker  0.000369774 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  25.8 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  25.8 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  27.04 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  27.54 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  27.54 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  30.69 
 
 		 694 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3422  transcriptional regulator, DeoR family  31.78 
 
 		 331 aa  99.4  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00167672  hitchhiker  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2573  putative sugar-binding region  28.76 
 
 		 337 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 326 aa  99.4  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  29.68 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  28.16 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  28.71 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  28.71 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  28.71 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  28.71 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  28.71 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  29.55 
 
 		 700 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 363 aa  96.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 312 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 333 aa  96.3  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5338  transcriptional regulator  31.44 
 
 		 313 aa  95.5  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 326 aa  95.9  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0417  citrate lyase regulator  23.03 
 
 		 319 aa  95.9  9e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2553  DeoR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2598  DeoR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0969479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2643  transcriptional regulator, DeoR family  28.12 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000047791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2592  DeoR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0641807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5157  transcriptional regulator, DeoR family  29.35 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  25.16 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3585  hypothetical protein  28.85 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0184789  normal  0.871841 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  26.45 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  23.57 
 
 		 316 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4738  DeoR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  27.96 
 
 		 319 aa  92.8  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4358  DeoR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 339 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0522  transcriptional regulator  29.87 
 
 		 319 aa  92.8  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4444  DeoR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 339 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0599387 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 331 aa  92.8  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  22.55 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  27.22 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 331 aa  92.4  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29850  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  31 
 
 		 317 aa  92.4  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  28.71 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  27.57 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  23.82 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  29.64 
 
 		 695 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06255  deoxyribonucleoside regulator/dihydroxyacetone kinase  25.24 
 
 		 333 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3606  DeoR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 334 aa  89.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>