221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2598 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2553  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 342 aa  677    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2598  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 342 aa  677    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0969479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2592  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 342 aa  677    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0641807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2088  transcriptional regulator, DeoR family  60.76 
 
 		 315 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29850  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  42.67 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5338  transcriptional regulator  33.55 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  32.26 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  26.54 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  27.48 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  29.15 
 
 		 319 aa  126  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  32.5 
 
 		 694 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 326 aa  123  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  25.94 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.83 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  31.33 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  33.23 
 
 		 694 aa  119  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.33 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  31.33 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.33 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.33 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  33.23 
 
 		 700 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.19 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.51 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  28.62 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  28.62 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  31.01 
 
 		 315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  28 
 
 		 315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 315 aa  116  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 341 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  33.33 
 
 		 695 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  24.69 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  28.21 
 
 		 327 aa  110  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  28.8 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  23.82 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  30.31 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  29.9 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  27.33 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 363 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4826  DeoR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.658414  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4738  DeoR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 326 aa  97.1  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  29.87 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  26.48 
 
 		 315 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  28.66 
 
 		 323 aa  96.3  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  27.33 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  27.33 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03820  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  30.72 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3997  transcriptional regulator, DeoR family  28.75 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.150923 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  29.03 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  25.3 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 335 aa  94  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  26.71 
 
 		 316 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  27.33 
 
 		 313 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  27.33 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  28.23 
 
 		 321 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2790  DeoR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 306 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4358  DeoR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  27.55 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2834  DeoR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 306 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4444  DeoR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0599387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2817  DeoR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 306 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0275474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  27.55 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2573  putative sugar-binding region  28.83 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5157  transcriptional regulator, DeoR family  27.76 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 314 aa  90.5  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  30.16 
 
 		 310 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  29.41 
 
 		 317 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  25.55 
 
 		 310 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 317 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 333 aa  89.7  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  27.93 
 
 		 332 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  27.41 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  29.07 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  29.07 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  29.41 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  29.17 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  29.07 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  27.41 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  29.07 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  29.07 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  29.07 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  29.07 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  29.17 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  27.93 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  29.12 
 
 		 317 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  26.58 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3422  transcriptional regulator, DeoR family  31.69 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00167672  hitchhiker  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5885  DeoR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 339 aa  87  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>