207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0304 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0304  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 324 aa  620  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2797  transcriptional regulator, DeoR family  45.21 
 
 		 315 aa  245  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3997  transcriptional regulator, DeoR family  45.18 
 
 		 312 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2790  DeoR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 306 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2834  DeoR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 306 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2817  DeoR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 306 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0275474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1461  transcriptional regulator, DeoR family  36.54 
 
 		 318 aa  182  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3263  DeoR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 321 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0573  transcriptional regulator, DeoR family  36.04 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  29.08 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  31.23 
 
 		 323 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 323 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  30.33 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1639  DeoR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294849  hitchhiker  0.00400864 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  31 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2156  transcriptional regulator, DeoR family  31.56 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  28.21 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2573  putative sugar-binding region  30.84 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  28 
 
 		 326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  30.79 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  30.79 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  31.13 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 326 aa  112  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  25.81 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0532  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  31.09 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  31.09 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  31.09 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  31.09 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  31.09 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  31.09 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  31.09 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 339 aa  106  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  24.68 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4826  DeoR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.658414  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0561  transcriptional regulator, DeoR family  32.25 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  29.21 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4358  DeoR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4444  DeoR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0599387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3426  transcriptional regulator, DeoR family  31.55 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  hitchhiker  0.000369774 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.65 
 
 		 315 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  27.65 
 
 		 316 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 320 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  29.58 
 
 		 325 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000492  transcriptional regulator  27.39 
 
 		 333 aa  99  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.32 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  25.32 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.32 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.32 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4738  DeoR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.32 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  25.32 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  25.32 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  24.68 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06255  deoxyribonucleoside regulator/dihydroxyacetone kinase  27.06 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.32 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  25 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  29.8 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  29.87 
 
 		 328 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 317 aa  96.3  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 325 aa  96.3  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03820  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  31.38 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 357 aa  95.1  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0417  citrate lyase regulator  21.63 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06830  transcriptional regulator  30.03 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 315 aa  93.6  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5338  transcriptional regulator  30.32 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 334 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29950  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  31.94 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 342 aa  93.2  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 318 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2251  DeoR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0678126  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3043  DeoR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3288  transcriptional regulator, DeoR family  32.78 
 
 		 324 aa  89  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal  0.0190392 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  21.57 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1923  DeoR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3422  transcriptional regulator, DeoR family  30.82 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00167672  hitchhiker  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2217  sugar-binding domain-containing protein  31.35 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0880863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1813  sugar-binding domain-containing protein  31.35 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1988  transcriptional regulator, DeoR family  29.19 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000190118 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  28 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 326 aa  86.7  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0488  transcriptional regulator, DeoR family  30.87 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 345 aa  85.9  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  22.36 
 
 		 315 aa  85.9  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29850  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  30.55 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3725  transcriptional regulator, DeoR family  23.75 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000852212  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  21.27 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2553  DeoR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2598  DeoR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0969479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2592  DeoR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0641807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0710  DeoR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0415966  normal  0.409033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>