200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06830 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06830  transcriptional regulator  100 
 
 		 320 aa  645    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0561  transcriptional regulator, DeoR family  70 
 
 		 322 aa  443  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0488  transcriptional regulator, DeoR family  71.61 
 
 		 317 aa  430  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3288  transcriptional regulator, DeoR family  59.74 
 
 		 324 aa  361  1e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal  0.0190392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2251  DeoR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 320 aa  325  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0678126  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1988  transcriptional regulator, DeoR family  51.28 
 
 		 324 aa  319  3e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000190118 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29950  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  49.84 
 
 		 319 aa  288  8e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1869  transcriptional regulator, DeoR family  42.07 
 
 		 335 aa  249  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  31.63 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.31 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.31 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  31.31 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.31 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.31 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.31 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.31 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  30.99 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  27.3 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  29.32 
 
 		 323 aa  126  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0532  transcriptional regulator  30.84 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  29.81 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3725  transcriptional regulator, DeoR family  27.39 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000852212  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  29.28 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  30.39 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  22.55 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  23.23 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  30.38 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2156  transcriptional regulator, DeoR family  28.52 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2790  DeoR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2834  DeoR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2817  DeoR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0275474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2797  transcriptional regulator, DeoR family  32.01 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  23.95 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  23.95 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  26.6 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  22.85 
 
 		 321 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 333 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  28.39 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  23.62 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  25.33 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  27.3 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  27.36 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 339 aa  99.8  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3776  DeoR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 313 aa  99.4  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02313  putative transcriptional regulator  27.18 
 
 		 318 aa  99.4  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00764074  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  28.12 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  27.78 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4826  DeoR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.658414  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  24.52 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  26.06 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  27.1 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06255  deoxyribonucleoside regulator/dihydroxyacetone kinase  27.44 
 
 		 333 aa  96.7  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 312 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  26.77 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4358  DeoR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 339 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4444  DeoR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 339 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0599387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  25.66 
 
 		 326 aa  95.9  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3753  transcriptional regulator, DeoR family  27.8 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  26.38 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000492  transcriptional regulator  26.98 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  26.42 
 
 		 334 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0090  operon regulator SmoC  28.71 
 
 		 317 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0568695  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1680  DeoR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3043  DeoR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 325 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  27.33 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4738  DeoR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 339 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1726  DeoR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2359  DeoR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 342 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  21.17 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 331 aa  91.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5885  DeoR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2573  putative sugar-binding region  26.6 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0643  DeoR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  25.81 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  25.81 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  25.81 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  25.81 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  25.81 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  25.48 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  25.48 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 323 aa  89.4  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.165471 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>