204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4826 on replicon NC_009672
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009672  Oant_4826  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
326 aa  671    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.658414  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5885  DeoR family transcriptional regulator  86.46 
 
 
326 aa  597  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0522  transcriptional regulator  37.82 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
326 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  34.73 
 
 
694 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  29.9 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  34.08 
 
 
694 aa  162  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
341 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  31.67 
 
 
333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  30.32 
 
 
700 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  32.58 
 
 
695 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  28.76 
 
 
321 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  26.69 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  26.92 
 
 
313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  25.08 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  26.71 
 
 
316 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  26.92 
 
 
362 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  27.24 
 
 
310 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  26.6 
 
 
310 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  27.24 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  25.72 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
320 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  25.48 
 
 
310 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  25.96 
 
 
315 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
315 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  27.04 
 
 
327 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  26.03 
 
 
315 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.55 
 
 
316 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.55 
 
 
315 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  26.97 
 
 
334 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.71 
 
 
315 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  25.71 
 
 
315 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.71 
 
 
315 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.23 
 
 
315 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  28.08 
 
 
319 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.71 
 
 
315 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
312 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  28.34 
 
 
320 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
310 aa  105  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  25.4 
 
 
315 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  25.5 
 
 
323 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
363 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  27.45 
 
 
317 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
317 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  27.12 
 
 
317 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  27.12 
 
 
317 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  27.12 
 
 
317 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0643  DeoR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
330 aa  99.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  26.8 
 
 
317 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
310 aa  99.8  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
312 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  23.33 
 
 
315 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06830  transcriptional regulator  25.16 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3043  DeoR family transcriptional regulator  26.75 
 
 
325 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2553  DeoR family transcriptional regulator  29.97 
 
 
342 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3288  transcriptional regulator, DeoR family  29.11 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal  0.0190392 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2598  DeoR family transcriptional regulator  29.97 
 
 
342 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0969479  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2592  DeoR family transcriptional regulator  29.97 
 
 
342 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0641807  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2797  transcriptional regulator, DeoR family  29.08 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
307 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0561  transcriptional regulator, DeoR family  24.6 
 
 
322 aa  96.3  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0304  transcriptional regulator, DeoR family  30.23 
 
 
324 aa  95.9  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  24.92 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  24.92 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  24.92 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0532  transcriptional regulator  26.1 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  24.92 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29950  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  27.74 
 
 
319 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  24.92 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
339 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  29.08 
 
 
325 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  24.35 
 
 
321 aa  92.8  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4738  DeoR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
339 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4358  DeoR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
339 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4444  DeoR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
339 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0599387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
333 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  29.08 
 
 
325 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0488  transcriptional regulator, DeoR family  25.88 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  23.73 
 
 
319 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2088  transcriptional regulator, DeoR family  29.68 
 
 
315 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  26.75 
 
 
334 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
339 aa  90.5  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  23.89 
 
 
332 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1869  transcriptional regulator, DeoR family  27.78 
 
 
335 aa  89.4  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273722  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  20.06 
 
 
313 aa  89.4  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  23.96 
 
 
321 aa  89  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  25.25 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  24.84 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  25.48 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  24.43 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3776  DeoR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
313 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  25.81 
 
 
315 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
339 aa  87.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  25.81 
 
 
315 aa  87.4  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  27.81 
 
 
325 aa  87  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03820  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  28.12 
 
 
318 aa  86.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>