208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02313 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02313  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 318 aa  657    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00764074  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4121  DeoR family transcriptional regulator  56.01 
 
 		 319 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1900  transcriptional regulator, DeoR family protein  52.53 
 
 		 320 aa  347  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3776  DeoR family transcriptional regulator  51.31 
 
 		 313 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2359  DeoR family transcriptional regulator  50.95 
 
 		 317 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1726  DeoR family transcriptional regulator  46.52 
 
 		 317 aa  310  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0090  operon regulator SmoC  46.2 
 
 		 317 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0568695  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1680  DeoR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3753  transcriptional regulator, DeoR family  49.37 
 
 		 317 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3563  hypothetical protein  48.42 
 
 		 317 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3451  transcriptional regulator, DeoR family  50.67 
 
 		 316 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0914  transcriptional regulator  44.16 
 
 		 317 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0496  DeoR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 322 aa  275  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.858474  hitchhiker  0.000586642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0728  putative transcriptional regulator  42.07 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4174  DeoR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1923  DeoR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1813  sugar-binding domain-containing protein  43.18 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2217  sugar-binding domain-containing protein  43.18 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0880863 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1045  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 		 315 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0701  transcriptional regulator, putative  42.21 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0641  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 		 315 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2476  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 		 315 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.528896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0883  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 		 315 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300696  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0886  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 		 315 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0089  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 		 315 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0342  transcriptional regulator, putative  42.27 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3240  transcriptional regulator, DeoR family  41.29 
 
 		 333 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0632  DeoR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289497  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1720  DeoR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.925466  normal  0.0186791 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0710  DeoR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0415966  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2635  DeoR family transcriptional regulator  41 
 
 		 340 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2506  DeoR family transcriptional regulator  41 
 
 		 345 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140537  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2127  putative transcriptional regulator (repressor) transcription regulator protein  40.32 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5918  DeoR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1977  DeoR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2587  DeoR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2611  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.682873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  33.77 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  35.55 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 345 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 316 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0867  erythritol transcriptional regulator  31.13 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 342 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2565  DeoR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3043  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1661  DeoR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 345 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  30.37 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  30.94 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0532  transcriptional regulator  26.54 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  27.76 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  30.62 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  29.43 
 
 		 334 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 312 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  27.06 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  29.22 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  27.97 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  27.97 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  27.97 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  27.97 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  27.97 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0643  DeoR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 330 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  28.12 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.45 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.45 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  27.45 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  27.45 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.45 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  28.52 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.12 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.12 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  27.62 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  27.15 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  26.8 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  27.12 
 
 		 315 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  27.48 
 
 		 310 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  26.69 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  26.69 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  26.69 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  26.98 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  27.96 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  26.82 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  27.15 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  26.37 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  26.98 
 
 		 362 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  27.15 
 
 		 310 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  27.15 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>