208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0573 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0573  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 312 aa  618  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2797  transcriptional regulator, DeoR family  39.02 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3997  transcriptional regulator, DeoR family  36.3 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2790  DeoR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2834  DeoR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2817  DeoR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0275474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  32.17 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0304  transcriptional regulator, DeoR family  35.55 
 
 		 324 aa  125  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 320 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1461  transcriptional regulator, DeoR family  31.03 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3263  DeoR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  31.05 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1639  DeoR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294849  hitchhiker  0.00400864 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 341 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2573  putative sugar-binding region  27.5 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  22.3 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  29.94 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  26.89 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2565  DeoR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  26.56 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  26.56 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  26.56 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  26.56 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  26.56 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  28.43 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  29.08 
 
 		 338 aa  95.9  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 334 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  28.8 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 345 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000492  transcriptional regulator  26.06 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  22.93 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  22.73 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0710  DeoR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 335 aa  89.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0415966  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3585  hypothetical protein  25.97 
 
 		 321 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0184789  normal  0.871841 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06255  deoxyribonucleoside regulator/dihydroxyacetone kinase  25.73 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  26.73 
 
 		 325 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  23.62 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  23.62 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  26.37 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  27.52 
 
 		 694 aa  86.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  24.14 
 
 		 332 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 317 aa  85.9  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  26.73 
 
 		 325 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2127  putative transcriptional regulator (repressor) transcription regulator protein  27.54 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  25.55 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  23.82 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  24.27 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  24.04 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29850  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  29.28 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5157  transcriptional regulator, DeoR family  25.84 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  23.95 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  23.95 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0632  DeoR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 318 aa  82.4  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289497  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2635  DeoR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3606  DeoR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  24.04 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  23.62 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  20.77 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  24.03 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  25.78 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2506  DeoR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140537  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5885  DeoR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  23.38 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0867  erythritol transcriptional regulator  26.88 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5918  DeoR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  27.52 
 
 		 694 aa  79.7  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1977  DeoR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2587  DeoR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0522  transcriptional regulator  24.44 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2611  DeoR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 337 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.682873  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  24.27 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3240  transcriptional regulator, DeoR family  25.5 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0643  DeoR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.427449 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  25 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  25.59 
 
 		 700 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  25 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  26.42 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.625003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>