218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3240 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3240  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 333 aa  680    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0728  putative transcriptional regulator  95.87 
 
 		 315 aa  618  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0496  DeoR family transcriptional regulator  87.86 
 
 		 322 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.858474  hitchhiker  0.000586642 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0701  transcriptional regulator, putative  81.96 
 
 		 339 aa  534  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0342  transcriptional regulator, putative  82.64 
 
 		 315 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1045  putative transcriptional regulator  82.96 
 
 		 315 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0641  putative transcriptional regulator  82.96 
 
 		 315 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2476  putative transcriptional regulator  82.96 
 
 		 315 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.528896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0883  putative transcriptional regulator  82.96 
 
 		 315 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300696  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0886  putative transcriptional regulator  82.96 
 
 		 315 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0089  putative transcriptional regulator  82.96 
 
 		 315 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156043  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0710  DeoR family transcriptional regulator  78.75 
 
 		 335 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0415966  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2127  putative transcriptional regulator (repressor) transcription regulator protein  79.05 
 
 		 315 aa  518  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2635  DeoR family transcriptional regulator  79.87 
 
 		 340 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2506  DeoR family transcriptional regulator  79.55 
 
 		 345 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140537  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5918  DeoR family transcriptional regulator  78.59 
 
 		 337 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2611  DeoR family transcriptional regulator  78.14 
 
 		 337 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.682873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1977  DeoR family transcriptional regulator  78.46 
 
 		 337 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2587  DeoR family transcriptional regulator  78.46 
 
 		 337 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2217  sugar-binding domain-containing protein  54.34 
 
 		 318 aa  342  4e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0880863 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1923  DeoR family transcriptional regulator  54.34 
 
 		 318 aa  342  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1813  sugar-binding domain-containing protein  54.34 
 
 		 318 aa  342  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0632  DeoR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02313  putative transcriptional regulator  41.29 
 
 		 318 aa  265  7e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00764074  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4121  DeoR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3776  DeoR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3563  hypothetical protein  41.94 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3753  transcriptional regulator, DeoR family  43.04 
 
 		 317 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1900  transcriptional regulator, DeoR family protein  39.29 
 
 		 320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481716  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3451  transcriptional regulator, DeoR family  44.15 
 
 		 316 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0914  transcriptional regulator  40.26 
 
 		 317 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1680  DeoR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 317 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0090  operon regulator SmoC  41.18 
 
 		 317 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0568695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1726  DeoR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 317 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2359  DeoR family transcriptional regulator  41.37 
 
 		 317 aa  225  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4174  DeoR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1720  DeoR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 331 aa  205  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.925466  normal  0.0186791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 345 aa  195  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  36.98 
 
 		 338 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  36.66 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2565  DeoR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0867  erythritol transcriptional regulator  34.54 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  33.44 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1661  DeoR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 345 aa  152  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  33.23 
 
 		 325 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  32.29 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0532  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3043  DeoR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 325 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  29.78 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  30.82 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  28.39 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  32.91 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  29.49 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  29.7 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  29.7 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  29.7 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  29.7 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  29.7 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  26.97 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  27.83 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  27.51 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.853311 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  27.51 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  27.51 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  27.51 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  29.11 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  28.62 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 312 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 341 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  29.77 
 
 		 694 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  29.68 
 
 		 694 aa  103  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0643  DeoR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 330 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0550  transcriptional regulator  26.63 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  25.61 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  25.61 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  26.89 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  26.89 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  26.89 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  26.89 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  26.89 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  26.89 
 
 		 339 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  27.96 
 
 		 700 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  25.61 
 
 		 315 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  26.05 
 
 		 332 aa  96.3  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  25.56 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>