210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0701 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0701  transcriptional regulator, putative  100 
 
 
339 aa  687    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0342  transcriptional regulator, putative  96.51 
 
 
315 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1045  putative transcriptional regulator  96.83 
 
 
315 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0641  putative transcriptional regulator  96.83 
 
 
315 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2476  putative transcriptional regulator  96.83 
 
 
315 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.528896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0883  putative transcriptional regulator  96.83 
 
 
315 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300696  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0886  putative transcriptional regulator  96.83 
 
 
315 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0089  putative transcriptional regulator  96.83 
 
 
315 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156043  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2506  DeoR family transcriptional regulator  85.4 
 
 
345 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140537  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0710  DeoR family transcriptional regulator  84.45 
 
 
335 aa  559  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0415966  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2635  DeoR family transcriptional regulator  85.71 
 
 
340 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5918  DeoR family transcriptional regulator  83.95 
 
 
337 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2611  DeoR family transcriptional regulator  83.54 
 
 
337 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.682873  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1977  DeoR family transcriptional regulator  83.85 
 
 
337 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2587  DeoR family transcriptional regulator  83.85 
 
 
337 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2127  putative transcriptional regulator (repressor) transcription regulator protein  84.24 
 
 
315 aa  537  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3240  transcriptional regulator, DeoR family  81.96 
 
 
333 aa  534  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0728  putative transcriptional regulator  81.99 
 
 
315 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0496  DeoR family transcriptional regulator  82.64 
 
 
322 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.858474  hitchhiker  0.000586642 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2217  sugar-binding domain-containing protein  53.65 
 
 
318 aa  344  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0880863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1813  sugar-binding domain-containing protein  53.65 
 
 
318 aa  344  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1923  DeoR family transcriptional regulator  53.65 
 
 
318 aa  344  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02313  putative transcriptional regulator  42.21 
 
 
318 aa  267  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00764074  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0632  DeoR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
318 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3776  DeoR family transcriptional regulator  44.84 
 
 
313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4121  DeoR family transcriptional regulator  42.63 
 
 
319 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0914  transcriptional regulator  40.69 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0090  operon regulator SmoC  43.32 
 
 
317 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0568695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1726  DeoR family transcriptional regulator  43 
 
 
317 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1900  transcriptional regulator, DeoR family protein  39.81 
 
 
320 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481716  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1680  DeoR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
317 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388051  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4174  DeoR family transcriptional regulator  42.63 
 
 
310 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2359  DeoR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
317 aa  233  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711472  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3753  transcriptional regulator, DeoR family  42.63 
 
 
317 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188827  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3451  transcriptional regulator, DeoR family  42.81 
 
 
316 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3563  hypothetical protein  40.97 
 
 
317 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1720  DeoR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
331 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.925466  normal  0.0186791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
345 aa  202  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  38.16 
 
 
338 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  35.86 
 
 
311 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  35.55 
 
 
316 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0867  erythritol transcriptional regulator  34.64 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
342 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2565  DeoR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
336 aa  169  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  32.3 
 
 
325 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  34.38 
 
 
325 aa  155  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1661  DeoR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
345 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  32.38 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3043  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
325 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  29.03 
 
 
319 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0532  transcriptional regulator  30.43 
 
 
324 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
310 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 
321 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
323 aa  123  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  30.13 
 
 
321 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  29.9 
 
 
306 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  30 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  30 
 
 
319 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  30 
 
 
319 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  30 
 
 
319 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  30 
 
 
319 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  29.24 
 
 
312 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  31.35 
 
 
319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
339 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
320 aa  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4738  DeoR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4358  DeoR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
339 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4444  DeoR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
339 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0599387 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  29.09 
 
 
339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  29.09 
 
 
339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  29.09 
 
 
339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  29.09 
 
 
339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  29.09 
 
 
339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  29.09 
 
 
339 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  27.16 
 
 
317 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3606  DeoR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
334 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  28.66 
 
 
339 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  27.69 
 
 
317 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
335 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  27.69 
 
 
317 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  26.32 
 
 
334 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
317 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  27.69 
 
 
317 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  26.85 
 
 
317 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0643  DeoR family transcriptional regulator  25.48 
 
 
330 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
333 aa  105  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5157  transcriptional regulator, DeoR family  26.97 
 
 
334 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  28.29 
 
 
320 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
357 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0550  transcriptional regulator  28.16 
 
 
323 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  29.41 
 
 
694 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
341 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
333 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  27.19 
 
 
333 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
307 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>