198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0914 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0914  transcriptional regulator  100 
 
 		 317 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4121  DeoR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 319 aa  308  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3776  DeoR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 313 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3753  transcriptional regulator, DeoR family  49.84 
 
 		 317 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2359  DeoR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1900  transcriptional regulator, DeoR family protein  44.9 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481716  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3563  hypothetical protein  47.95 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3451  transcriptional regulator, DeoR family  49.33 
 
 		 316 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02313  putative transcriptional regulator  44.16 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00764074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1726  DeoR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 317 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0090  operon regulator SmoC  46.3 
 
 		 317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0568695  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1680  DeoR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4174  DeoR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 310 aa  251  9.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0710  DeoR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 335 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0415966  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0701  transcriptional regulator, putative  40.69 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1045  putative transcriptional regulator  42.07 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0641  putative transcriptional regulator  42.07 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2476  putative transcriptional regulator  42.07 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.528896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0883  putative transcriptional regulator  42.07 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300696  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0886  putative transcriptional regulator  42.07 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0089  putative transcriptional regulator  42.07 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0342  transcriptional regulator, putative  41.75 
 
 		 315 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0632  DeoR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289497  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1720  DeoR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 331 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.925466  normal  0.0186791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0728  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2635  DeoR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2127  putative transcriptional regulator (repressor) transcription regulator protein  40.91 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2506  DeoR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 345 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140537  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0496  DeoR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.858474  hitchhiker  0.000586642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3240  transcriptional regulator, DeoR family  40.26 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5918  DeoR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 337 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1977  DeoR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2587  DeoR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2611  DeoR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 337 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.682873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2217  sugar-binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0880863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1813  sugar-binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1923  DeoR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  36.39 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  35.22 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  33 
 
 		 345 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0867  erythritol transcriptional regulator  31.96 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2565  DeoR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 336 aa  156  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 322 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3043  DeoR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 325 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  28.62 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  28.52 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  30.39 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 325 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1661  DeoR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 345 aa  112  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  28.85 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  31.15 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0532  transcriptional regulator  26.54 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  28.83 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  28.83 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  28.83 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  28.83 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  28.83 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  29.1 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  28.7 
 
 		 317 aa  105  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 320 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  28.4 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  27.72 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  28.98 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  28.98 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  28.75 
 
 		 317 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  27.15 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  26.86 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  26.73 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 362 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  27.06 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  27.18 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0550  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  27.06 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  27.04 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 331 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0643  DeoR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  25.63 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  25.63 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  25.24 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  23.89 
 
 		 315 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  27.42 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  24.92 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  24.92 
 
 		 315 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  24.92 
 
 		 315 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  24.92 
 
 		 315 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  27.12 
 
 		 694 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>