217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1661 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1661  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 345 aa  675    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2565  DeoR family transcriptional regulator  55.59 
 
 		 336 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 345 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  41.21 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  41.77 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 316 aa  243  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0867  erythritol transcriptional regulator  39.68 
 
 		 316 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 342 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0090  operon regulator SmoC  37.04 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0568695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1726  DeoR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1680  DeoR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0701  transcriptional regulator, putative  34.38 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1045  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0641  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2476  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.528896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0883  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300696  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0886  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0089  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156043  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3043  DeoR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0342  transcriptional regulator, putative  34.69 
 
 		 315 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2127  putative transcriptional regulator (repressor) transcription regulator protein  35.6 
 
 		 315 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0710  DeoR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 335 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0415966  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0728  putative transcriptional regulator  33.76 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1720  DeoR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.925466  normal  0.0186791 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5918  DeoR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1923  DeoR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 318 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2217  sugar-binding domain-containing protein  34.41 
 
 		 318 aa  170  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0880863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3240  transcriptional regulator, DeoR family  33.76 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1813  sugar-binding domain-containing protein  34.41 
 
 		 318 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2506  DeoR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 345 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140537  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0496  DeoR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.858474  hitchhiker  0.000586642 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2635  DeoR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 340 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1977  DeoR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2587  DeoR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2611  DeoR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 337 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.682873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3776  DeoR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02313  putative transcriptional regulator  31.07 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00764074  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0632  DeoR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 310 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4121  DeoR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 319 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  31.19 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  31.38 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0914  transcriptional regulator  32.72 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  31.38 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 		 310 aa  146  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1900  transcriptional regulator, DeoR family protein  28.34 
 
 		 320 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  30.77 
 
 		 310 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  31.08 
 
 		 310 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  31.38 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3753  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 317 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  32.5 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2359  DeoR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3451  transcriptional regulator, DeoR family  31.7 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  32.69 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  32.72 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  32.72 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  32.72 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  31.21 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  32.72 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  32.72 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  30.06 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  31.11 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3563  hypothetical protein  32.04 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0532  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  31.06 
 
 		 306 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  31.58 
 
 		 317 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  31.58 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  31.58 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  31.58 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4174  DeoR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  31.27 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  28.39 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  28.71 
 
 		 325 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  33.23 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  26.77 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0643  DeoR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3585  hypothetical protein  28.93 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0184789  normal  0.871841 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  25.08 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  22.88 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 331 aa  105  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  27.6 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3606  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 316 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>