210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0632 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0632  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
318 aa  632  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289497  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0728  putative transcriptional regulator  43.49 
 
 
315 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0710  DeoR family transcriptional regulator  43.87 
 
 
335 aa  275  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0415966  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3240  transcriptional regulator, DeoR family  42.39 
 
 
333 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0496  DeoR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
322 aa  269  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.858474  hitchhiker  0.000586642 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2127  putative transcriptional regulator (repressor) transcription regulator protein  42.86 
 
 
315 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2635  DeoR family transcriptional regulator  43.46 
 
 
340 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1045  putative transcriptional regulator  43.87 
 
 
315 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0641  putative transcriptional regulator  43.87 
 
 
315 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2476  putative transcriptional regulator  43.87 
 
 
315 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.528896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0883  putative transcriptional regulator  43.87 
 
 
315 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300696  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0886  putative transcriptional regulator  43.87 
 
 
315 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0089  putative transcriptional regulator  43.87 
 
 
315 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0342  transcriptional regulator, putative  43.55 
 
 
315 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2506  DeoR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
345 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140537  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0701  transcriptional regulator, putative  43.55 
 
 
339 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02313  putative transcriptional regulator  42.72 
 
 
318 aa  263  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00764074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2611  DeoR family transcriptional regulator  43.46 
 
 
337 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.682873  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5918  DeoR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
337 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1977  DeoR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
337 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2587  DeoR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
337 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4121  DeoR family transcriptional regulator  42.48 
 
 
319 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1900  transcriptional regulator, DeoR family protein  42.81 
 
 
320 aa  251  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3776  DeoR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
313 aa  242  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0914  transcriptional regulator  41.35 
 
 
317 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3753  transcriptional regulator, DeoR family  41.97 
 
 
317 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188827  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4174  DeoR family transcriptional regulator  41.37 
 
 
310 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3563  hypothetical protein  41.64 
 
 
317 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2217  sugar-binding domain-containing protein  40.45 
 
 
318 aa  235  6e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0880863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1813  sugar-binding domain-containing protein  40.45 
 
 
318 aa  235  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1923  DeoR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
318 aa  235  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2359  DeoR family transcriptional regulator  42.3 
 
 
317 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711472  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3451  transcriptional regulator, DeoR family  40.94 
 
 
316 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1726  DeoR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
317 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0090  operon regulator SmoC  40.19 
 
 
317 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0568695  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1680  DeoR family transcriptional regulator  39.87 
 
 
317 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388051  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1720  DeoR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
331 aa  202  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.925466  normal  0.0186791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
345 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  41.21 
 
 
342 aa  199  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  37.7 
 
 
311 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  35.29 
 
 
338 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0867  erythritol transcriptional regulator  34.21 
 
 
316 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2565  DeoR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
336 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3043  DeoR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
325 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0532  transcriptional regulator  32.6 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  34 
 
 
325 aa  145  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  31.89 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  31.23 
 
 
325 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
322 aa  135  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  32.38 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  31.85 
 
 
317 aa  132  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
320 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  31.88 
 
 
334 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  31.85 
 
 
317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  31.85 
 
 
317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  31.09 
 
 
319 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  31.09 
 
 
319 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  31.09 
 
 
319 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  31.09 
 
 
319 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  31.53 
 
 
317 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  31.53 
 
 
317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  30.79 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  32.18 
 
 
319 aa  129  6e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  28.57 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  30.72 
 
 
694 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0643  DeoR family transcriptional regulator  28.34 
 
 
330 aa  126  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1661  DeoR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
345 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  30.49 
 
 
694 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
339 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
307 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  28.8 
 
 
310 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3606  DeoR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
334 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  28.8 
 
 
310 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  32.13 
 
 
700 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
310 aa  122  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  28.16 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  31.27 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  28.8 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  28.39 
 
 
310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  31.7 
 
 
320 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  28.48 
 
 
313 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  28.16 
 
 
316 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  28.48 
 
 
362 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  31.48 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
312 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5157  transcriptional regulator, DeoR family  31.51 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
312 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  27.04 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  28.29 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
339 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0550  transcriptional regulator  29.26 
 
 
323 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  24.84 
 
 
321 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
333 aa  106  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
326 aa  106  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  28.8 
 
 
339 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>