32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0549 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0549  shikimate kinase  100 
 
 		 284 aa  564  1e-160  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1354  shikimate kinase  33.8 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0247  shikimate kinase  34.52 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1651  shikimate kinase  32.28 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00233159 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0875  shikimate kinase  31.54 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1322  shikimate kinase  31.18 
 
 		 283 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.600611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1872  shikimate kinase  32.33 
 
 		 266 aa  126  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0631  shikimate kinase  29.43 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3127  shikimate kinase  31.94 
 
 		 288 aa  122  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1331  shikimate kinase  32.26 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1354  shikimate kinase  28.72 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1283  shikimate kinase  35.45 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1876  shikimate kinase  27.15 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.537362  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1857  shikimate kinase  30.74 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3396  shikimate kinase  24.76 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5133  shikimate kinase  26.5 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2042  shikimate kinase  29.71 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3025  shikimate kinase  26.1 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1792  shikimate kinase  29.39 
 
 		 271 aa  85.9  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.604666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2348  shikimate kinase  25.44 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.152308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0915  shikimate kinase  27.97 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0811  shikimate kinase  27.5 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  21.48 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  22.01 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  28.57 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  28.24 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  21.32 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  25.1 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  34.52 
 
 		 318 aa  43.1  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  23.01 
 
 		 314 aa  42.7  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0885  homoserine kinase  25.1 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  22.56 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>