55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0247 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0247  shikimate kinase  100 
 
 		 294 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0631  shikimate kinase  63.76 
 
 		 283 aa  357  9e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1322  shikimate kinase  63.76 
 
 		 283 aa  354  8.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.600611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1354  shikimate kinase  62.72 
 
 		 283 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1331  shikimate kinase  62.72 
 
 		 283 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3127  shikimate kinase  41.32 
 
 		 288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0875  shikimate kinase  41.78 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1354  shikimate kinase  39.24 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3396  shikimate kinase  34.98 
 
 		 309 aa  168  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1876  shikimate kinase  34.98 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.537362  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5133  shikimate kinase  36.92 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2348  shikimate kinase  37.82 
 
 		 292 aa  162  9e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.152308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3025  shikimate kinase  35.29 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1651  shikimate kinase  32.28 
 
 		 280 aa  143  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00233159 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0549  shikimate kinase  34.52 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1872  shikimate kinase  31.5 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1792  shikimate kinase  32.03 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.604666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2042  shikimate kinase  32.64 
 
 		 271 aa  116  6e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0915  shikimate kinase  31.34 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0811  shikimate kinase  32.39 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1283  shikimate kinase  34.41 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1857  shikimate kinase  27.84 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  23.66 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  23.66 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  23.66 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  23.66 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  23.66 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  21.84 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  21.84 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  21.84 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  21.84 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  21.84 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  21.84 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  21.84 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  21.84 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  21.84 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  21.47 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  22.64 
 
 		 315 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  24.58 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1493  homoserine kinase  25.22 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00125886  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  22.26 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  21.45 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  24.47 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  24.36 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  20.52 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  21.69 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  20.52 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  22.22 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  20.52 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  21.21 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  21.72 
 
 		 331 aa  45.8  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  21.88 
 
 		 309 aa  45.8  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1495  homoserine kinase  24.09 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.122475  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  25.34 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  24.11 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>