25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0915 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0915  shikimate kinase  100 
 
 		 271 aa  538  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2042  shikimate kinase  75.09 
 
 		 271 aa  422  1e-117  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1792  shikimate kinase  73.68 
 
 		 271 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.604666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0811  shikimate kinase  76.3 
 
 		 271 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1876  shikimate kinase  36.5 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.537362  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3127  shikimate kinase  33.2 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3025  shikimate kinase  38.04 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3396  shikimate kinase  36.09 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0875  shikimate kinase  34.22 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5133  shikimate kinase  36.43 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1872  shikimate kinase  33.71 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1354  shikimate kinase  32.85 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1651  shikimate kinase  31.87 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00233159 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1354  shikimate kinase  35.92 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0631  shikimate kinase  32.85 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2348  shikimate kinase  33.46 
 
 		 292 aa  105  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.152308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1322  shikimate kinase  32.74 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.600611  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1283  shikimate kinase  31.3 
 
 		 268 aa  99  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0247  shikimate kinase  31.34 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1331  shikimate kinase  30.14 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1857  shikimate kinase  31.28 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0549  shikimate kinase  27.97 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  36.46 
 
 		 349 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  36.67 
 
 		 376 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  35.04 
 
 		 393 aa  42  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>