24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1651 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1651  shikimate kinase  100 
 
 		 280 aa  564  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00233159 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0875  shikimate kinase  44.75 
 
 		 287 aa  175  8e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3127  shikimate kinase  40.23 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1354  shikimate kinase  42.86 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5133  shikimate kinase  37.83 
 
 		 292 aa  143  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2348  shikimate kinase  38.37 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.152308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3396  shikimate kinase  37.01 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3025  shikimate kinase  37.05 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1876  shikimate kinase  36.49 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.537362  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0247  shikimate kinase  32.28 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1354  shikimate kinase  33.7 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2042  shikimate kinase  34.07 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1792  shikimate kinase  34.81 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.604666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1322  shikimate kinase  32.34 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.600611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0631  shikimate kinase  33.2 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0549  shikimate kinase  32.28 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0811  shikimate kinase  35.19 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1872  shikimate kinase  30.86 
 
 		 266 aa  114  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1331  shikimate kinase  32.83 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0915  shikimate kinase  31.87 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1857  shikimate kinase  31.13 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1283  shikimate kinase  27.04 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3355  homoserine kinase  24.4 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000409306  hitchhiker  0.0000000000000103928 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  30.61 
 
 		 296 aa  42.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>