31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1857 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1857  shikimate kinase  100 
 
 		 268 aa  538  9.999999999999999e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1872  shikimate kinase  39.84 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1283  shikimate kinase  37.12 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1651  shikimate kinase  31.17 
 
 		 280 aa  98.6  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00233159 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1792  shikimate kinase  32.92 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.604666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1876  shikimate kinase  27.8 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.537362  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0549  shikimate kinase  30.74 
 
 		 284 aa  96.7  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0875  shikimate kinase  31.08 
 
 		 287 aa  95.9  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2042  shikimate kinase  31.71 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0811  shikimate kinase  32.92 
 
 		 271 aa  92  9e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3025  shikimate kinase  29.51 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3127  shikimate kinase  29.9 
 
 		 288 aa  89  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1354  shikimate kinase  32.45 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3396  shikimate kinase  32 
 
 		 309 aa  85.5  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0915  shikimate kinase  31.28 
 
 		 271 aa  85.5  9e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5133  shikimate kinase  31.63 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1354  shikimate kinase  27.9 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0631  shikimate kinase  27.74 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1322  shikimate kinase  27.74 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.600611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2348  shikimate kinase  30.54 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.152308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1331  shikimate kinase  26.01 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0247  shikimate kinase  27.84 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1418  homoserine kinase  23.92 
 
 		 304 aa  48.9  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.011674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  23.92 
 
 		 304 aa  48.9  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0261  homoserine kinase  30.4 
 
 		 308 aa  46.6  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000622844 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2097  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol kinase  25.91 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  27.27 
 
 		 357 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  27.27 
 
 		 356 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0599  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  22.55 
 
 		 289 aa  42  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  40.43 
 
 		 350 aa  42  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  40.43 
 
 		 350 aa  42  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>