67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1331 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1331  shikimate kinase  100 
 
 		 283 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1322  shikimate kinase  77.39 
 
 		 283 aa  427  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.600611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1354  shikimate kinase  77.74 
 
 		 283 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0631  shikimate kinase  76.33 
 
 		 283 aa  423  1e-117  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0247  shikimate kinase  62.72 
 
 		 294 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3127  shikimate kinase  42.86 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0875  shikimate kinase  40.21 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3396  shikimate kinase  34.22 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1354  shikimate kinase  41.97 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3025  shikimate kinase  34.91 
 
 		 283 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5133  shikimate kinase  35.51 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1876  shikimate kinase  32.33 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.537362  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2348  shikimate kinase  33.94 
 
 		 292 aa  156  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.152308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1651  shikimate kinase  32.83 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00233159 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0549  shikimate kinase  32.26 
 
 		 284 aa  132  9e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1872  shikimate kinase  29.85 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2042  shikimate kinase  31.77 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1792  shikimate kinase  32.46 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.604666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0915  shikimate kinase  32.62 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1283  shikimate kinase  31.29 
 
 		 268 aa  105  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0811  shikimate kinase  30.6 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1857  shikimate kinase  28.52 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  26.84 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  21.97 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  21.97 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  21.97 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  21.97 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  21.97 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  25.78 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  26.11 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  22.96 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  22.96 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  22.96 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  22.96 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  22.96 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  22.96 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  22.96 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  22.33 
 
 		 309 aa  52.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  22.96 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  22.96 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  28.51 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  22.58 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  23.15 
 
 		 309 aa  49.3  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  22.73 
 
 		 309 aa  48.9  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  24.69 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  23.99 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  22.4 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  31.03 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  21.86 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  24.69 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  21.86 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  21.86 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  21.76 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  24.12 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  23.85 
 
 		 315 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0246  homoserine kinase  25.32 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00137655  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  23.95 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  23.97 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3039  homoserine kinase  22.12 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  23.85 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  23.43 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2702  GHMP kinase  26.11 
 
 		 301 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2905  homoserine kinase  22.8 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0674  homoserine kinase  23.91 
 
 		 293 aa  42.7  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0444063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  27.78 
 
 		 311 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1271  homoserine kinase  21.71 
 
 		 311 aa  42.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1493  homoserine kinase  24.08 
 
 		 294 aa  42  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00125886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>