23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2348 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2348  shikimate kinase  100 
 
 		 292 aa  584  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.152308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3025  shikimate kinase  66.79 
 
 		 283 aa  343  2e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3396  shikimate kinase  62.75 
 
 		 309 aa  338  5e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5133  shikimate kinase  65.6 
 
 		 292 aa  335  5e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1876  shikimate kinase  60.13 
 
 		 297 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.537362  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3127  shikimate kinase  46.18 
 
 		 288 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0875  shikimate kinase  47.64 
 
 		 287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1354  shikimate kinase  50.77 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0247  shikimate kinase  36.39 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1651  shikimate kinase  38.37 
 
 		 280 aa  142  9e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00233159 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1354  shikimate kinase  35.03 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1322  shikimate kinase  34.69 
 
 		 283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.600611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0631  shikimate kinase  34.35 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1331  shikimate kinase  33.94 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2042  shikimate kinase  33.85 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0915  shikimate kinase  33.46 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1792  shikimate kinase  34.24 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.604666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1872  shikimate kinase  30 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0811  shikimate kinase  34.63 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1283  shikimate kinase  25.7 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0549  shikimate kinase  25.44 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1857  shikimate kinase  28.78 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82625  galactokinase  31.4 
 
 		 518 aa  47.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.560809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>