28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0875 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0875  shikimate kinase  100 
 
 		 287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3127  shikimate kinase  64.41 
 
 		 288 aa  381  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1354  shikimate kinase  52.71 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1876  shikimate kinase  48.64 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.537362  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3396  shikimate kinase  45.24 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5133  shikimate kinase  49.28 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2348  shikimate kinase  47.64 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.152308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3025  shikimate kinase  48.3 
 
 		 283 aa  238  8e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0247  shikimate kinase  41.78 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1354  shikimate kinase  39.55 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1651  shikimate kinase  44.75 
 
 		 280 aa  175  8e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00233159 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0631  shikimate kinase  39.55 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1322  shikimate kinase  38.99 
 
 		 283 aa  171  9e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.600611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1331  shikimate kinase  40.36 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2042  shikimate kinase  32.69 
 
 		 271 aa  122  9e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0915  shikimate kinase  34.22 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1792  shikimate kinase  34.2 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.604666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0549  shikimate kinase  31.54 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0811  shikimate kinase  34.04 
 
 		 271 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1872  shikimate kinase  31.56 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1283  shikimate kinase  30.12 
 
 		 268 aa  92.8  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1857  shikimate kinase  31.08 
 
 		 268 aa  90.1  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0133  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  24.31 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00187677  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  21.48 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  23.22 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0599  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  24.23 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10263  predicted protein  25.56 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111228  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0376  homoserine kinase  27.24 
 
 		 296 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>