209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0376 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0376  homoserine kinase  100 
 
 
296 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0054  homoserine kinase  76.87 
 
 
298 aa  410  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0972  homoserine kinase  79.93 
 
 
297 aa  394  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.779201  normal  0.0398229 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1078  homoserine kinase  73.81 
 
 
296 aa  392  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  0.147957 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  36.58 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  35.35 
 
 
309 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  34.56 
 
 
311 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  32.18 
 
 
305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  31.83 
 
 
305 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  33.65 
 
 
320 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  32.67 
 
 
297 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0179  homoserine kinase  35.64 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0944739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  32.04 
 
 
307 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  32.32 
 
 
305 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  34.2 
 
 
309 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0672  homoserine kinase  32.23 
 
 
311 aa  112  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000904789 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  30.14 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  35.16 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  32.33 
 
 
316 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0261  homoserine kinase  33.82 
 
 
308 aa  109  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000622844 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  28.91 
 
 
311 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  30.87 
 
 
304 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  29.49 
 
 
300 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  32.53 
 
 
315 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1644  homoserine kinase  34.23 
 
 
291 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  38.12 
 
 
320 aa  105  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  31.03 
 
 
315 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  30.26 
 
 
303 aa  105  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0058  homoserine kinase  33.78 
 
 
291 aa  104  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.188045  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  43.66 
 
 
320 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  34.8 
 
 
320 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0833  homoserine kinase  28.83 
 
 
312 aa  103  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  32.38 
 
 
320 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  32.29 
 
 
315 aa  102  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  35.96 
 
 
320 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  31.51 
 
 
315 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1306  homoserine kinase  27.97 
 
 
302 aa  102  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.460055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  30.59 
 
 
301 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  30.1 
 
 
303 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  29.7 
 
 
306 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  31.51 
 
 
302 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1378  homoserine kinase  30.22 
 
 
301 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  27.84 
 
 
307 aa  99.4  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  27.9 
 
 
308 aa  99.4  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  29.93 
 
 
309 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  29.93 
 
 
309 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  29.93 
 
 
309 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  29.93 
 
 
309 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  29.93 
 
 
309 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  33.86 
 
 
320 aa  99  9e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  31.65 
 
 
315 aa  98.2  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  32.11 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1298  homoserine kinase  29.63 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0658  homoserine kinase  29.48 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.411206  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2574  homoserine kinase  34.12 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  33.33 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  29.66 
 
 
311 aa  97.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2050  homoserine kinase  33.22 
 
 
300 aa  96.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.189135  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3310  homoserine kinase  30.56 
 
 
293 aa  96.3  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  32.65 
 
 
296 aa  96.3  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  31.62 
 
 
315 aa  95.9  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  31.73 
 
 
293 aa  95.5  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  31.62 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  32.21 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  29.27 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  30 
 
 
309 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  27.65 
 
 
304 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  29.27 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  29.21 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  30.13 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  29.21 
 
 
310 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  29.27 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  29.27 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  29.27 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  29.27 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  29.27 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  27.51 
 
 
300 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0246  homoserine kinase  29.9 
 
 
294 aa  94  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00137655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3355  homoserine kinase  30.77 
 
 
297 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000409306  hitchhiker  0.0000000000000103928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  29.37 
 
 
309 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  33.8 
 
 
307 aa  92.8  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1972  homoserine kinase  31.47 
 
 
297 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0856158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  28.62 
 
 
309 aa  92.4  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  28.62 
 
 
309 aa  92.4  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  28.62 
 
 
309 aa  92.4  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0118  homoserine kinase  34.94 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  28.73 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1493  homoserine kinase  28.12 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00125886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1827  homoserine kinase  30.88 
 
 
297 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.115577  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  32.18 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1970  homoserine kinase  30.88 
 
 
297 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.358252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1368  homoserine kinase  27.44 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  28.47 
 
 
323 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2075  homoserine kinase  30.88 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000541431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1784  homoserine kinase  30.53 
 
 
297 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0220  homoserine kinase  29.12 
 
 
292 aa  89.7  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000123965  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  28.14 
 
 
323 aa  89.7  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  28.25 
 
 
309 aa  89.7  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1801  homoserine kinase  30.88 
 
 
297 aa  89.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0151771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2004  homoserine kinase  30.88 
 
 
297 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.268179999999999e-43 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>