22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1792 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1792  shikimate kinase  100 
 
 		 271 aa  541  1e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.604666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0811  shikimate kinase  89.89 
 
 		 271 aa  477  1e-133  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2042  shikimate kinase  78.28 
 
 		 271 aa  442  1e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0915  shikimate kinase  73.68 
 
 		 271 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1651  shikimate kinase  34.81 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00233159 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3127  shikimate kinase  35.46 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3025  shikimate kinase  37.21 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3396  shikimate kinase  35.06 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0875  shikimate kinase  34.2 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1872  shikimate kinase  34.73 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1876  shikimate kinase  33.58 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.537362  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5133  shikimate kinase  34.41 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1354  shikimate kinase  38.52 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1354  shikimate kinase  32.97 
 
 		 283 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0247  shikimate kinase  32.03 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1322  shikimate kinase  34.43 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.600611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0631  shikimate kinase  33.33 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1283  shikimate kinase  32.44 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2348  shikimate kinase  34.24 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.152308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1331  shikimate kinase  32.32 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1857  shikimate kinase  32.92 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0549  shikimate kinase  29.39 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>