61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0631 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0631  shikimate kinase  100 
 
 		 283 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1322  shikimate kinase  95.76 
 
 		 283 aa  518  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.600611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1354  shikimate kinase  96.11 
 
 		 283 aa  519  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1331  shikimate kinase  76.33 
 
 		 283 aa  408  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0247  shikimate kinase  63.76 
 
 		 294 aa  360  1e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3127  shikimate kinase  44.58 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0875  shikimate kinase  39.55 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1354  shikimate kinase  42.5 
 
 		 288 aa  185  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3396  shikimate kinase  34.67 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1876  shikimate kinase  34.71 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.537362  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5133  shikimate kinase  37.26 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3025  shikimate kinase  34.94 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2348  shikimate kinase  35.63 
 
 		 292 aa  145  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.152308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1651  shikimate kinase  31.97 
 
 		 280 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00233159 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1872  shikimate kinase  30.22 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0549  shikimate kinase  29.43 
 
 		 284 aa  125  7e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2042  shikimate kinase  33.7 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0915  shikimate kinase  32.85 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1792  shikimate kinase  33.33 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.604666  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1283  shikimate kinase  30.74 
 
 		 268 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0811  shikimate kinase  32.23 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1857  shikimate kinase  27.64 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  26.92 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  28.32 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  28.76 
 
 		 308 aa  52.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  21.4 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  22.78 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  22.78 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  22.78 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1493  homoserine kinase  26.42 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00125886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  22.78 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  24.02 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  21.65 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  21.65 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  21.65 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  21.65 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  21.65 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  21.65 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  21.65 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  23.61 
 
 		 315 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  23.04 
 
 		 315 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  24.55 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  23.48 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  21.4 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1057  homoserine kinase  24.42 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  23.76 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  23.53 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  21.82 
 
 		 309 aa  45.8  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0674  homoserine kinase  25.5 
 
 		 293 aa  45.8  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0444063  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  25.12 
 
 		 316 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  21.84 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0220  homoserine kinase  25.79 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000123965  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  26.72 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1495  homoserine kinase  24.5 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.122475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  26.67 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  25.38 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  24.2 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  22.77 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  23.53 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0246  homoserine kinase  25.49 
 
 		 294 aa  42.7  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00137655  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  20.66 
 
 		 309 aa  42.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>