22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_3025 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_3025  shikimate kinase  100 
 
 		 283 aa  553  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1876  shikimate kinase  70.31 
 
 		 297 aa  375  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.537362  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2348  shikimate kinase  66.9 
 
 		 292 aa  352  5e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.152308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5133  shikimate kinase  65.82 
 
 		 292 aa  341  1e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3396  shikimate kinase  63 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3127  shikimate kinase  47.74 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0875  shikimate kinase  48.3 
 
 		 287 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1354  shikimate kinase  50.2 
 
 		 288 aa  192  5e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1354  shikimate kinase  34.36 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1331  shikimate kinase  34.02 
 
 		 283 aa  142  7e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0631  shikimate kinase  34.36 
 
 		 283 aa  142  8e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1322  shikimate kinase  34.02 
 
 		 283 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.600611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0247  shikimate kinase  34.02 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1651  shikimate kinase  37.05 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00233159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2042  shikimate kinase  36.14 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0915  shikimate kinase  38.25 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1792  shikimate kinase  37.21 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.604666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0811  shikimate kinase  37.75 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1872  shikimate kinase  33.33 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1857  shikimate kinase  29.51 
 
 		 268 aa  85.9  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1283  shikimate kinase  28.1 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0549  shikimate kinase  26.1 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>