23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1283 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1283  shikimate kinase  100 
 
 		 268 aa  532  1e-150  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1872  shikimate kinase  57.69 
 
 		 266 aa  296  2e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1857  shikimate kinase  37.12 
 
 		 268 aa  149  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2042  shikimate kinase  32.45 
 
 		 271 aa  115  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1354  shikimate kinase  33.08 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0549  shikimate kinase  35.45 
 
 		 284 aa  105  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1792  shikimate kinase  32.44 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.604666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0631  shikimate kinase  29.78 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0811  shikimate kinase  32.44 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1322  shikimate kinase  29.67 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.600611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0915  shikimate kinase  31.3 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1354  shikimate kinase  28.68 
 
 		 283 aa  99  8e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0247  shikimate kinase  34.05 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0875  shikimate kinase  30.12 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3127  shikimate kinase  31.37 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1331  shikimate kinase  34.62 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1651  shikimate kinase  27.04 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00233159 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3025  shikimate kinase  28.1 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2348  shikimate kinase  25.7 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.152308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3396  shikimate kinase  27.27 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1876  shikimate kinase  24.3 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.537362  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5133  shikimate kinase  25.9 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  32.65 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>