23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5133 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013747  Htur_5133  shikimate kinase  100 
 
 		 292 aa  566  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3396  shikimate kinase  78.52 
 
 		 309 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3025  shikimate kinase  65.82 
 
 		 283 aa  341  7e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2348  shikimate kinase  65.38 
 
 		 292 aa  338  7e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.152308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1876  shikimate kinase  63.67 
 
 		 297 aa  329  3e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.537362  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0875  shikimate kinase  47.4 
 
 		 287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3127  shikimate kinase  43.94 
 
 		 288 aa  235  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1354  shikimate kinase  51.16 
 
 		 288 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0247  shikimate kinase  37.32 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1651  shikimate kinase  37.68 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00233159 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1331  shikimate kinase  35.74 
 
 		 283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0631  shikimate kinase  37.26 
 
 		 283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1322  shikimate kinase  38.02 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.600611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1354  shikimate kinase  34.34 
 
 		 283 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0915  shikimate kinase  36.43 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2042  shikimate kinase  34.63 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1792  shikimate kinase  34.41 
 
 		 271 aa  112  9e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.604666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0811  shikimate kinase  34.41 
 
 		 271 aa  95.9  8e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1872  shikimate kinase  32.26 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1857  shikimate kinase  31.63 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0549  shikimate kinase  26.5 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1283  shikimate kinase  25.9 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1479  homoserine kinase  24.81 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>