24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1872 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1872  shikimate kinase  100 
 
 		 266 aa  530  1e-150  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1283  shikimate kinase  57.69 
 
 		 268 aa  296  2e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1857  shikimate kinase  39.84 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2042  shikimate kinase  34.1 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0631  shikimate kinase  30.22 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1792  shikimate kinase  34.73 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.604666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1322  shikimate kinase  29.85 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.600611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1651  shikimate kinase  30.86 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00233159 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0549  shikimate kinase  32.33 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1354  shikimate kinase  28.73 
 
 		 283 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0915  shikimate kinase  33.71 
 
 		 271 aa  111  9e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0247  shikimate kinase  31.5 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0875  shikimate kinase  31.56 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0811  shikimate kinase  35.11 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1331  shikimate kinase  28.57 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1876  shikimate kinase  32.64 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.537362  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3127  shikimate kinase  32.57 
 
 		 288 aa  99.8  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3025  shikimate kinase  33.33 
 
 		 283 aa  96.3  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5133  shikimate kinase  32.26 
 
 		 292 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1354  shikimate kinase  32.46 
 
 		 288 aa  94  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3396  shikimate kinase  30.41 
 
 		 309 aa  93.6  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2348  shikimate kinase  30 
 
 		 292 aa  92.8  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.152308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  38.6 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0632  homoserine kinase  26.24 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.305614  decreased coverage  0.0010744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>