24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2042 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2042  shikimate kinase  100 
 
 		 271 aa  547  1e-155  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1792  shikimate kinase  78.28 
 
 		 271 aa  442  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.604666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0811  shikimate kinase  80.3 
 
 		 271 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0915  shikimate kinase  75.09 
 
 		 271 aa  422  1e-117  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3127  shikimate kinase  34.77 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1876  shikimate kinase  36.4 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.537362  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3025  shikimate kinase  36.14 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1651  shikimate kinase  34.07 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00233159 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0875  shikimate kinase  32.69 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1872  shikimate kinase  34.1 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3396  shikimate kinase  35.58 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1283  shikimate kinase  32.45 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1354  shikimate kinase  37.31 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5133  shikimate kinase  34.63 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2348  shikimate kinase  33.85 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.152308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1322  shikimate kinase  33.45 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.600611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1354  shikimate kinase  32.97 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0631  shikimate kinase  33.7 
 
 		 283 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0247  shikimate kinase  32.39 
 
 		 294 aa  102  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1331  shikimate kinase  31.77 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1857  shikimate kinase  31.71 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0549  shikimate kinase  29.71 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  28.67 
 
 		 392 aa  43.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  27.61 
 
 		 359 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>