23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3396 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3396  shikimate kinase  100 
 
 		 309 aa  608  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5133  shikimate kinase  78.95 
 
 		 292 aa  428  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2348  shikimate kinase  63.67 
 
 		 292 aa  333  3e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.152308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3025  shikimate kinase  63.86 
 
 		 283 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1876  shikimate kinase  60.06 
 
 		 297 aa  308  5.9999999999999995e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.537362  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0875  shikimate kinase  45.24 
 
 		 287 aa  240  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3127  shikimate kinase  44.55 
 
 		 288 aa  239  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1354  shikimate kinase  45.63 
 
 		 288 aa  191  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0247  shikimate kinase  34.98 
 
 		 294 aa  155  9e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1354  shikimate kinase  34.67 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0631  shikimate kinase  34.67 
 
 		 283 aa  149  8e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1331  shikimate kinase  34.22 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1322  shikimate kinase  34.33 
 
 		 283 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.600611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1651  shikimate kinase  37.01 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00233159 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0915  shikimate kinase  36.09 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1792  shikimate kinase  35.06 
 
 		 271 aa  119  7e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.604666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2042  shikimate kinase  35.58 
 
 		 271 aa  116  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0811  shikimate kinase  35.38 
 
 		 271 aa  103  5e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1872  shikimate kinase  30.41 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1857  shikimate kinase  32 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0549  shikimate kinase  24.76 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1283  shikimate kinase  27.27 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2356  beta-ribofuranosylaminobenzene 5'-phosphate synthase family  26.88 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>