31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1354 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1354  shikimate kinase  100 
 
 		 288 aa  567  1e-161  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0875  shikimate kinase  52.71 
 
 		 287 aa  278  9e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3127  shikimate kinase  50.35 
 
 		 288 aa  275  6e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1876  shikimate kinase  47.64 
 
 		 297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.537362  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2348  shikimate kinase  51.54 
 
 		 292 aa  215  7e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.152308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3025  shikimate kinase  50.6 
 
 		 283 aa  212  7e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3396  shikimate kinase  46.28 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5133  shikimate kinase  51.16 
 
 		 292 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1354  shikimate kinase  42.14 
 
 		 283 aa  192  6e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0631  shikimate kinase  42.5 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1322  shikimate kinase  42.86 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.600611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0247  shikimate kinase  39.24 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1651  shikimate kinase  42.86 
 
 		 280 aa  178  9e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00233159 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1331  shikimate kinase  41.97 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0549  shikimate kinase  33.8 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1792  shikimate kinase  38.52 
 
 		 271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.604666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2042  shikimate kinase  37.31 
 
 		 271 aa  136  4e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0915  shikimate kinase  35.92 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1283  shikimate kinase  33.08 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0811  shikimate kinase  38.52 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1872  shikimate kinase  33.09 
 
 		 266 aa  115  8.999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1857  shikimate kinase  32.45 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  26.88 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0599  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  23.79 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  27.27 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  24.62 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  23.85 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  24.23 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  24.55 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  23.46 
 
 		 315 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  30.11 
 
 		 317 aa  42.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>