33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3127 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3127  shikimate kinase  100 
 
 		 288 aa  584  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0875  shikimate kinase  64.41 
 
 		 287 aa  381  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1354  shikimate kinase  50.35 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2348  shikimate kinase  46.18 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.152308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3025  shikimate kinase  47.74 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3396  shikimate kinase  44.55 
 
 		 309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283997  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5133  shikimate kinase  45.45 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1876  shikimate kinase  47.39 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.537362  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0247  shikimate kinase  41.32 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1322  shikimate kinase  45.38 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.600611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0631  shikimate kinase  44.58 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1354  shikimate kinase  44.58 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1331  shikimate kinase  42.86 
 
 		 283 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1651  shikimate kinase  40.23 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00233159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2042  shikimate kinase  34.77 
 
 		 271 aa  132  6e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1792  shikimate kinase  35.46 
 
 		 271 aa  125  9e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.604666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0915  shikimate kinase  33.2 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0811  shikimate kinase  34.26 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0549  shikimate kinase  31.94 
 
 		 284 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1872  shikimate kinase  32.57 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1283  shikimate kinase  31.37 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1857  shikimate kinase  29.9 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7478  GHMP kinase  35.14 
 
 		 328 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0133  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  24.23 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00187677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  22.22 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  24.71 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1057  homoserine kinase  24.71 
 
 		 317 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0043  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  23.95 
 
 		 289 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0044  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  23.95 
 
 		 292 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1097  homoserine kinase  31.21 
 
 		 314 aa  42.7  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  25.61 
 
 		 316 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  24.26 
 
 		 296 aa  42.4  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  21.01 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>