284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1942 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  100 
 
 		 318 aa  655    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  88.05 
 
 		 323 aa  590  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  87.74 
 
 		 323 aa  587  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  83.02 
 
 		 318 aa  550  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  74.76 
 
 		 309 aa  487  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  73.8 
 
 		 309 aa  482  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  72.52 
 
 		 309 aa  474  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  71.88 
 
 		 309 aa  476  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  71.57 
 
 		 309 aa  471  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  70.93 
 
 		 309 aa  467  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  70.93 
 
 		 309 aa  467  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  70.93 
 
 		 309 aa  467  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  70.42 
 
 		 310 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  70.74 
 
 		 310 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  70.74 
 
 		 310 aa  464  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  70.74 
 
 		 310 aa  463  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  70.74 
 
 		 310 aa  463  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  70.74 
 
 		 310 aa  463  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  70.74 
 
 		 310 aa  463  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  70.42 
 
 		 310 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  70.74 
 
 		 310 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  69.33 
 
 		 309 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  69.33 
 
 		 309 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  69.33 
 
 		 309 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  69.33 
 
 		 309 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  69.33 
 
 		 309 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  68.69 
 
 		 309 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  62.99 
 
 		 314 aa  427  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1276  homoserine kinase  61.32 
 
 		 318 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  54.29 
 
 		 328 aa  356  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1176  homoserine kinase  55.1 
 
 		 312 aa  352  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  53.38 
 
 		 331 aa  352  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0906  homoserine kinase  56.15 
 
 		 314 aa  348  6e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3414  homoserine kinase  55.13 
 
 		 312 aa  345  5e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1228  homoserine kinase  54.57 
 
 		 320 aa  344  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2734  homoserine kinase  54.57 
 
 		 320 aa  344  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3085  homoserine kinase  54.72 
 
 		 321 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479885  hitchhiker  0.00212807 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1210  homoserine kinase  55.13 
 
 		 312 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03327  homoserine kinase  55.02 
 
 		 315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1305  homoserine kinase  54.26 
 
 		 320 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1272  homoserine kinase  54.26 
 
 		 320 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140701  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1139  homoserine kinase  55.13 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2905  homoserine kinase  53.7 
 
 		 319 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1080  homoserine kinase  55.13 
 
 		 316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.708816  normal  0.284936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1140  homoserine kinase  54.81 
 
 		 312 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0308198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1271  homoserine kinase  53.99 
 
 		 311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1067  homoserine kinase  55.45 
 
 		 311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2739  homoserine kinase  50 
 
 		 328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11354  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  35.02 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  32.3 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  30.6 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  30.6 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  32.33 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  34.01 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  32.51 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  33.33 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  30.82 
 
 		 309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  31.19 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  29.69 
 
 		 315 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  29.97 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  33 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  30.11 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  30.56 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  30.06 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  29.38 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  29.47 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  29.52 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  32.06 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  32.52 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  29.22 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  31.19 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  32.5 
 
 		 315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  31.14 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  31.46 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  30.69 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  28.21 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  29.49 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  30.6 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  32.73 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  32.28 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  29.13 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  29.58 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  29.89 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  30.75 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  29.75 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  30.19 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  29.97 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  34.8 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  34.8 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  30.23 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  32.37 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  27.16 
 
 		 307 aa  103  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  29.6 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1418  homoserine kinase  30.26 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.011674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  30.26 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  32.14 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  26.02 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0596  homoserine kinase  25.95 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  30.57 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  28.12 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>