More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4591 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4591  inner-membrane translocator  100 
 
 		 363 aa  680    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1780  ABC transporter permease protein  65.66 
 
 		 357 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22990  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  44.29 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0910597  normal  0.0451282 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 562 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3011  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 370 aa  123  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152809  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 346 aa  123  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  34.6 
 
 		 349 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 571 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 337 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.33 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 299 aa  110  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 360 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0351  inner-membrane translocator  38.82 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0132915  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 398 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1004  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2363  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0322104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  33.99 
 
 		 589 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3058  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12681  hitchhiker  0.000339523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  34.4 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5148  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  35.81 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4243  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.51 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 373 aa  106  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4712  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 348 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 317 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 321 aa  106  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  30.71 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  34.68 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1741  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 336 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0493356  normal  0.156459 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  31.61 
 
 		 593 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  30.97 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0217  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  28.76 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3558  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.288511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  31.27 
 
 		 614 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  29.07 
 
 		 663 aa  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  33.56 
 
 		 590 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0252  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 358 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.231195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  35.65 
 
 		 345 aa  103  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4821  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 400 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0314054  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  30.97 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  30.79 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2955  inner-membrane translocator  29.27 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678807  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  28.34 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  32.78 
 
 		 590 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  32.64 
 
 		 830 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0263  inner-membrane translocator  33.06 
 
 		 358 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3362  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 358 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1135  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 298 aa  100  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  33.68 
 
 		 589 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0467  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 358 aa  99.8  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193008  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0431  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 320 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0346902  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  31 
 
 		 335 aa  99.4  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  32.87 
 
 		 590 aa  99.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 297 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.39 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0458  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.441083  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3572  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0134037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3033  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 390 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235152  normal  0.243359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  35.95 
 
 		 832 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7079  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livM  34.62 
 
 		 338 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5537  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  32.98 
 
 		 643 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  32.35 
 
 		 389 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0051  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 368 aa  97.1  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3610  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 358 aa  97.1  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963885  normal  0.413755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3018  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 390 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3064  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 426 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 327 aa  96.7  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  32.5 
 
 		 341 aa  96.3  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5036  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 362 aa  96.3  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1386  inner-membrane translocator  29.5 
 
 		 312 aa  96.3  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1385  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.44 
 
 		 423 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121753  normal  0.219132 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 358 aa  96.3  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0400  ABC transporter permease  29.28 
 
 		 316 aa  96.3  8e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 357 aa  95.9  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1463  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 358 aa  95.9  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0138  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2016  inner-membrane translocator  34.54 
 
 		 318 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0477  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>