More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0431 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0431  inner-membrane translocator  100 
 
 
320 aa  591  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0346902  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0351  inner-membrane translocator  43.42 
 
 
345 aa  203  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0132915  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1004  inner-membrane translocator  43.55 
 
 
333 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4821  inner-membrane translocator  45.96 
 
 
400 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0314054  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4712  inner-membrane translocator  41.44 
 
 
348 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4243  inner-membrane translocator  43.59 
 
 
339 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1741  inner-membrane translocator  40.75 
 
 
336 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0493356  normal  0.156459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3558  inner-membrane translocator  41.38 
 
 
336 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.288511  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7079  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livM  41.82 
 
 
338 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867419  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  37.13 
 
 
349 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.46 
 
 
325 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  40.55 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  38.49 
 
 
381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  37.31 
 
 
373 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.8 
 
 
646 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  37.4 
 
 
646 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  41.89 
 
 
346 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  36.22 
 
 
358 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  35.97 
 
 
327 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  32.3 
 
 
562 aa  152  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  37.16 
 
 
341 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  36.18 
 
 
345 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  34.32 
 
 
349 aa  149  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  36.45 
 
 
358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0299  inner-membrane translocator  36.96 
 
 
357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658484  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1863  inner-membrane translocator  36.33 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  40.31 
 
 
355 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  37.4 
 
 
648 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  31.83 
 
 
350 aa  145  9e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2306  inner-membrane translocator  38.1 
 
 
357 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5717  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  33.68 
 
 
357 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0477  inner-membrane translocator  36.74 
 
 
346 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210882  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  35.51 
 
 
647 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  32.37 
 
 
350 aa  142  6e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  32.46 
 
 
352 aa  142  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2374  inner-membrane translocator  40.46 
 
 
356 aa  142  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  35.32 
 
 
643 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  36.3 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000401  branched-chain amino acid transport system permease protein livM  35.43 
 
 
355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.241122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  37.7 
 
 
345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4178  inner-membrane translocator  35.71 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3414  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 
357 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  31.73 
 
 
350 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1652  inner-membrane translocator  37.07 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  32.86 
 
 
643 aa  139  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  35.29 
 
 
315 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0263  inner-membrane translocator  37.72 
 
 
358 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0217  inner-membrane translocator  39.08 
 
 
358 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
324 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  34.01 
 
 
321 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  36.18 
 
 
340 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4939  inner-membrane translocator  35.88 
 
 
358 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  34.78 
 
 
663 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  34.72 
 
 
310 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  33.81 
 
 
571 aa  136  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  44.59 
 
 
832 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  35.64 
 
 
319 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  32.09 
 
 
352 aa  135  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22990  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  36.49 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0910597  normal  0.0451282 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3979  ABC transporter permease  36.49 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1156  inner-membrane translocator  35.67 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.412429  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  32.38 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2440  inner-membrane translocator  36.16 
 
 
356 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1517  inner-membrane translocator  37.74 
 
 
309 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1834  inner-membrane translocator  35.97 
 
 
357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  35.93 
 
 
354 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  32.53 
 
 
317 aa  132  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3134  inner-membrane translocator  34.65 
 
 
357 aa  132  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.628981  normal  0.885727 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2608  inner-membrane translocator  33.46 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0678  inner-membrane translocator  34.24 
 
 
314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297461  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  32.62 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  35.84 
 
 
593 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  37.84 
 
 
830 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2722  inner-membrane translocator  35.52 
 
 
358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  0.425385 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0138  inner-membrane translocator  37.55 
 
 
358 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  36.12 
 
 
321 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
318 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
435 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  33.01 
 
 
353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2363  inner-membrane translocator  35.43 
 
 
325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0322104  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1545  inner-membrane translocator  39.25 
 
 
358 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.137578  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4551  inner-membrane translocator  35.69 
 
 
314 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  33.99 
 
 
328 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  36.07 
 
 
593 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0252  inner-membrane translocator  35.29 
 
 
358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.231195  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  30 
 
 
407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.98 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  32.95 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4011  inner-membrane translocator  38.83 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00177528  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.38 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  32.76 
 
 
330 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2473  inner-membrane translocator  36.09 
 
 
373 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  31.35 
 
 
415 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  32.39 
 
 
372 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  31.41 
 
 
321 aa  126  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4057  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.13 
 
 
424 aa  126  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1567  inner-membrane translocator  35.36 
 
 
357 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394848  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0100  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.68 
 
 
424 aa  125  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1386  inner-membrane translocator  33.84 
 
 
312 aa  125  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>