More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2374 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2374  inner-membrane translocator  100 
 
 		 356 aa  682    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2440  inner-membrane translocator  86.8 
 
 		 356 aa  564  1e-160  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 348 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  45.75 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  47.21 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  41.11 
 
 		 349 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  42.65 
 
 		 345 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  41.76 
 
 		 345 aa  232  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  40.65 
 
 		 349 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  37.61 
 
 		 350 aa  216  4e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  37.61 
 
 		 350 aa  215  9e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  37.32 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 373 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0138  inner-membrane translocator  43.87 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5009  inner-membrane translocator  40.34 
 
 		 354 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000401  branched-chain amino acid transport system permease protein livM  38.07 
 
 		 355 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.241122  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3134  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 357 aa  203  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.628981  normal  0.885727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3414  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.97 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1863  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0299  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658484  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  37.89 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2306  inner-membrane translocator  38.62 
 
 		 357 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2608  inner-membrane translocator  37.57 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2722  inner-membrane translocator  37.61 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  0.425385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1545  inner-membrane translocator  44.97 
 
 		 358 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.137578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0252  inner-membrane translocator  37.78 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.231195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0217  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4178  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 357 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3362  inner-membrane translocator  37.43 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1156  inner-membrane translocator  37.68 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.412429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0263  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0551  inner-membrane translocator  43.14 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 358 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5717  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  34.96 
 
 		 357 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1834  inner-membrane translocator  36.87 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0601  inner-membrane translocator  37.08 
 
 		 358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0458  inner-membrane translocator  36.94 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.441083  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3437  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0467  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193008  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0051  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 368 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0379  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livM  37.84 
 
 		 358 aa  179  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4005  inner-membrane translocator  34.54 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3539  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.17747  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3610  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 358 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.963885  normal  0.413755 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2220  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 358 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120044  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5289  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.975087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 407 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0784  inner-membrane translocator  38.07 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2276  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.73 
 
 		 358 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.158559  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0951  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 358 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5148  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  41.89 
 
 		 351 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4939  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 358 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4574  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0118  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43520  amino acid ABC transporter-like protein  40.35 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00847282  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 360 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 415 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1567  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394848  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2988  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.34 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.475714  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3801  inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3875  inner-membrane translocator  40.61 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3493  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5036  inner-membrane translocator  39.55 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3011  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1557  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 357 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.505429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 321 aa  155  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 562 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  37.01 
 
 		 830 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3003  inner-membrane translocator  39.67 
 
 		 354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3830  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 415 aa  152  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 328 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2750  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  39 
 
 		 354 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 300 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0477  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210882  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0351  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 345 aa  150  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0132915  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.96 
 
 		 325 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1724  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 		 459 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1113  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 460 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1790  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 		 459 aa  146  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 571 aa  146  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  35.5 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4243  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  37.01 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  36.56 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1652  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.5 
 
 		 418 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2363  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 325 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0322104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 407 aa  143  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 354 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.84 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2985  inner-membrane translocator  41.34 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.538372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3558  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.288511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1746  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 474 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>