More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1014 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1014  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
444 aa  852    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.506653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2663  major facilitator superfamily MFS_1  64.6 
 
 
446 aa  508  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.11892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  55.17 
 
 
441 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  47.22 
 
 
427 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  43.55 
 
 
436 aa  329  6e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  42.45 
 
 
450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  44.55 
 
 
436 aa  324  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  43.13 
 
 
468 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  43.66 
 
 
437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  42.43 
 
 
436 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4390  major facilitator transporter  42.18 
 
 
436 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  43.66 
 
 
437 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  42.43 
 
 
436 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  44 
 
 
434 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  42.43 
 
 
436 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  41.73 
 
 
433 aa  316  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  43.74 
 
 
439 aa  316  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1131  major facilitator transporter  42.43 
 
 
436 aa  315  9e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1143  major facilitator transporter  42.43 
 
 
436 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  42.21 
 
 
443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  42.21 
 
 
443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  42.21 
 
 
443 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  41.97 
 
 
443 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  42.79 
 
 
433 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  41.97 
 
 
443 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  41.97 
 
 
443 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  41.97 
 
 
443 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  44.52 
 
 
450 aa  310  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  42.58 
 
 
442 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  42.57 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  42.57 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  42.57 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  42.57 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  42.57 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  42.57 
 
 
444 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0241  major facilitator family transporter  42.08 
 
 
524 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67104  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  42.57 
 
 
444 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  44.21 
 
 
438 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  42.65 
 
 
433 aa  307  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  44.16 
 
 
441 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  42.34 
 
 
439 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  41.47 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  41.47 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  41.47 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.61 
 
 
438 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  40.1 
 
 
430 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  43.94 
 
 
435 aa  302  9e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  41 
 
 
432 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  41.23 
 
 
439 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.89 
 
 
437 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 
431 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  41.16 
 
 
439 aa  299  7e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  41 
 
 
439 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  46.25 
 
 
460 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  43.86 
 
 
442 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  46.27 
 
 
437 aa  298  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  44.92 
 
 
432 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  44.92 
 
 
432 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  44.92 
 
 
432 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1307  major facilitator family transporter  44.5 
 
 
437 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.702643  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  40.76 
 
 
439 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1154  major facilitator transporter  44.5 
 
 
437 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215313  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2216  major facilitator family transporter  44.5 
 
 
437 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0701  major facilitator family transporter  44.5 
 
 
437 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 
446 aa  296  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  41.9 
 
 
442 aa  295  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 
436 aa  296  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  41.46 
 
 
447 aa  295  9e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1146  major facilitator transporter  44.25 
 
 
437 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  41.61 
 
 
439 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  41.61 
 
 
439 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2535  major facilitator family transporter  44.5 
 
 
437 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.805911  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2079  major facilitator family transporter  44.5 
 
 
437 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  41.75 
 
 
434 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1835  major facilitator family transporter  41.69 
 
 
443 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  41.36 
 
 
439 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.23 
 
 
436 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  41.36 
 
 
439 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  41.51 
 
 
440 aa  293  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  41.36 
 
 
439 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  41.36 
 
 
439 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3435  major facilitator transporter  39.76 
 
 
446 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0701144  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.17 
 
 
437 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  39.76 
 
 
441 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  41.98 
 
 
439 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  39.14 
 
 
437 aa  290  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  40.57 
 
 
441 aa  289  9e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  39.58 
 
 
438 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  40.89 
 
 
457 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5174  major facilitator transporter  39.29 
 
 
441 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  39.58 
 
 
438 aa  288  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  40.89 
 
 
457 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4645  major facilitator transporter  39.53 
 
 
441 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372459  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  39.58 
 
 
438 aa  288  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  40.89 
 
 
457 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  39.58 
 
 
438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.58 
 
 
438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  39.58 
 
 
438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  39.58 
 
 
438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  39.58 
 
 
438 aa  286  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>