More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1945 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4411  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  75.62 
 
 
528 aa  808    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11375  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  62.55 
 
 
521 aa  641    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.763989  normal  0.42524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2383  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  63.98 
 
 
535 aa  638    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.962951  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2342  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  63.98 
 
 
535 aa  638    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1945  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  100 
 
 
526 aa  1053    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2389  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  63.98 
 
 
535 aa  638    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265242  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1723  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  62.07 
 
 
521 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1702  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  62.07 
 
 
521 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11665  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1770  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  62.1 
 
 
524 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0440023  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.33 
 
 
546 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.4 
 
 
560 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.08 
 
 
544 aa  262  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1935  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.98 
 
 
544 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0140383  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.37 
 
 
544 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.893245  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.37 
 
 
544 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0614831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1051  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.94 
 
 
544 aa  260  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4798  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.17 
 
 
544 aa  259  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.08 
 
 
544 aa  258  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4640  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.17 
 
 
544 aa  257  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5617  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.87 
 
 
544 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.36 
 
 
544 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.256075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5237  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.36 
 
 
544 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0398716  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.51 
 
 
563 aa  247  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.95 
 
 
562 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  38.44 
 
 
962 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  30.55 
 
 
936 aa  212  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 
949 aa  210  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  30.36 
 
 
852 aa  210  5e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 
586 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6150  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 
594 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102681  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 
586 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7411  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 
587 aa  206  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6493  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 
600 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.679743  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5637  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 
600 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6002  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 
600 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 
947 aa  204  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  30.8 
 
 
563 aa  204  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  30.67 
 
 
576 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  36.34 
 
 
586 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  35.47 
 
 
586 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  30.67 
 
 
573 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 
942 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  30.61 
 
 
576 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  30.48 
 
 
576 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  35.91 
 
 
1699 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  30.3 
 
 
573 aa  195  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 
958 aa  193  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  35.64 
 
 
577 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  31.23 
 
 
6889 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  32.58 
 
 
1035 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  34.66 
 
 
1801 aa  188  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 
958 aa  188  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 
648 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  33.25 
 
 
1789 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 
579 aa  186  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  33.76 
 
 
4317 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 
613 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  33.25 
 
 
4317 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  33.25 
 
 
4317 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 
653 aa  182  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  30.69 
 
 
3099 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  30.17 
 
 
7122 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
609 aa  180  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2880  AMP-binding domain-containing protein  32.5 
 
 
577 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0136  AMP-binding domain-containing protein  32.5 
 
 
577 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1452  AMP-binding domain-containing protein  32.5 
 
 
577 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3166  AMP-binding domain-containing protein  32.5 
 
 
588 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0531  AMP-binding domain-containing protein  32.25 
 
 
635 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.612015  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  33.59 
 
 
4317 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 
584 aa  177  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0549  AMP-binding domain-containing protein  32.25 
 
 
588 aa  177  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  30.38 
 
 
574 aa  176  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12955  acyl-CoA synthetase  30.07 
 
 
580 aa  176  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  31.77 
 
 
559 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0718  AMP-binding domain-containing protein  32.25 
 
 
686 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0642699  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  31.67 
 
 
588 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  29.29 
 
 
608 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0247  acyl-CoA synthetase  30.43 
 
 
590 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0257  acyl-CoA synthetase  30.43 
 
 
590 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  33.33 
 
 
4332 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0237  acyl-CoA synthetase  30.24 
 
 
590 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114716  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 
603 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 
595 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 
839 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1828  AMP-dependent synthetase and ligase  26.65 
 
 
576 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.397575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  34.87 
 
 
3235 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  29.45 
 
 
568 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  32.31 
 
 
585 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  29.03 
 
 
1474 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  31.64 
 
 
3231 aa  171  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  32.99 
 
 
1776 aa  170  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  34.01 
 
 
3208 aa  170  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10409  acyl-CoA synthetase  26.69 
 
 
585 aa  170  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  29.74 
 
 
755 aa  170  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  33.83 
 
 
4336 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  29.26 
 
 
573 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  33.83 
 
 
4318 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  32.6 
 
 
1753 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  30.4 
 
 
599 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  33.17 
 
 
2250 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>