More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3422 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 562 aa  1108    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.91 
 
 		 546 aa  339  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.09 
 
 		 563 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.77 
 
 		 560 aa  319  7e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.8 
 
 		 544 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.893245  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.8 
 
 		 544 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0614831 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.68 
 
 		 544 aa  296  5e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1935  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.8 
 
 		 544 aa  294  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0140383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4798  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.95 
 
 		 544 aa  293  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4640  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.54 
 
 		 544 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1051  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.15 
 
 		 544 aa  288  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5617  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.4 
 
 		 544 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.06 
 
 		 544 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5237  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.16 
 
 		 544 aa  281  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0398716  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.16 
 
 		 544 aa  281  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.256075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4411  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  36.31 
 
 		 528 aa  260  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  38.08 
 
 		 613 aa  257  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 		 577 aa  256  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  33.22 
 
 		 2791 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  32.84 
 
 		 936 aa  255  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  32.66 
 
 		 852 aa  253  9.000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11375  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  34.48 
 
 		 521 aa  252  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.763989  normal  0.42524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2383  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  36.02 
 
 		 535 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.962951  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2342  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  36.02 
 
 		 535 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2389  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  36.02 
 
 		 535 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  33.76 
 
 		 942 aa  245  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1945  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  34.58 
 
 		 526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 		 592 aa  239  6.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  39.95 
 
 		 653 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  41.31 
 
 		 3208 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 610 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 610 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  37.78 
 
 		 1067 aa  236  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 599 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  31.55 
 
 		 2820 aa  236  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 599 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  34.12 
 
 		 599 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  38.86 
 
 		 578 aa  234  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  34.69 
 
 		 610 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  35.52 
 
 		 1779 aa  234  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  32.92 
 
 		 962 aa  233  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 		 586 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  33.45 
 
 		 6889 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 947 aa  230  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 		 586 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  34.68 
 
 		 1789 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  36.15 
 
 		 4317 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  37.96 
 
 		 4317 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  34.75 
 
 		 6403 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  33.88 
 
 		 4332 aa  229  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 		 958 aa  229  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  36.04 
 
 		 4317 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  36.56 
 
 		 1801 aa  228  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 		 586 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  34.59 
 
 		 4317 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1702  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  33.64 
 
 		 521 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1723  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  33.64 
 
 		 521 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1770  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  33.45 
 
 		 524 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0440023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  34.16 
 
 		 4336 aa  226  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  34.85 
 
 		 2997 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 1035 aa  226  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 958 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  34.04 
 
 		 4336 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  37.88 
 
 		 4342 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  37.66 
 
 		 4342 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  31.81 
 
 		 1656 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  31.67 
 
 		 576 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.48 
 
 		 2762 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 		 648 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  31.61 
 
 		 574 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  31.67 
 
 		 576 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  31.67 
 
 		 573 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  35.58 
 
 		 4318 aa  220  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  31.67 
 
 		 573 aa  220  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  36.3 
 
 		 601 aa  219  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  31.5 
 
 		 576 aa  219  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  37.32 
 
 		 1699 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  36.04 
 
 		 603 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  33.03 
 
 		 949 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 586 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 		 614 aa  217  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  29.75 
 
 		 581 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 		 584 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  29.74 
 
 		 581 aa  215  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  31.09 
 
 		 563 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  37.18 
 
 		 568 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 		 839 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 		 596 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  35.18 
 
 		 701 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  33.25 
 
 		 608 aa  211  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  32.24 
 
 		 1323 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  32.44 
 
 		 3718 aa  210  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  31.86 
 
 		 1474 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6493  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 600 aa  208  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.679743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  29.98 
 
 		 588 aa  207  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5637  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 600 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6002  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 600 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7411  AMP-dependent synthetase and ligase  33.25 
 
 		 587 aa  206  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  35.96 
 
 		 3235 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6150  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 594 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102681  normal  0.566386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>