More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4411 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4411  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  100 
 
 
528 aa  1053    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1945  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  75.62 
 
 
526 aa  800    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1770  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  61.67 
 
 
524 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0440023  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2383  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  62.64 
 
 
535 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.962951  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1702  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  61.64 
 
 
521 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11665  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1723  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  61.64 
 
 
521 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2342  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  62.64 
 
 
535 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11375  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  60.69 
 
 
521 aa  622  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.763989  normal  0.42524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2389  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  62.64 
 
 
535 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265242  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.99 
 
 
546 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5617  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.43 
 
 
544 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5237  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.32 
 
 
544 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0398716  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.32 
 
 
544 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.256075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1935  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.82 
 
 
544 aa  269  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0140383  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.17 
 
 
544 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.67 
 
 
560 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.62 
 
 
544 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.893245  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.62 
 
 
544 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0614831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4798  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.62 
 
 
544 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4640  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.43 
 
 
544 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.56 
 
 
544 aa  261  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.31 
 
 
562 aa  260  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1051  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.98 
 
 
544 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.54 
 
 
563 aa  250  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  31.09 
 
 
936 aa  223  4.9999999999999996e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  30.9 
 
 
852 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6493  AMP-dependent synthetase and ligase  36.66 
 
 
600 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.679743  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5637  AMP-dependent synthetase and ligase  36.66 
 
 
600 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6002  AMP-dependent synthetase and ligase  36.66 
 
 
600 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 
586 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7411  AMP-dependent synthetase and ligase  36.34 
 
 
587 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  34.52 
 
 
947 aa  206  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6150  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 
594 aa  207  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102681  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  34.61 
 
 
949 aa  202  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  30.65 
 
 
576 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  31.21 
 
 
576 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 
958 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 
962 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 
577 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  30.65 
 
 
573 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  30.46 
 
 
576 aa  199  9e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  29.92 
 
 
563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2880  AMP-binding domain-containing protein  31.2 
 
 
577 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3166  AMP-binding domain-containing protein  31.2 
 
 
588 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  30.27 
 
 
573 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1452  AMP-binding domain-containing protein  31.2 
 
 
577 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0136  AMP-binding domain-containing protein  31.2 
 
 
577 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0549  AMP-binding domain-containing protein  31.01 
 
 
588 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0531  AMP-binding domain-containing protein  33.67 
 
 
635 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.612015  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0718  AMP-binding domain-containing protein  31.01 
 
 
686 aa  193  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0642699  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  34.83 
 
 
1699 aa  192  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  34 
 
 
1789 aa  190  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  28.98 
 
 
584 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  36.15 
 
 
1035 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 
586 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 
653 aa  188  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 
942 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 
958 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2049  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 
547 aa  186  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.998714  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 
586 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 
586 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  33.58 
 
 
603 aa  182  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  29.34 
 
 
608 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 
648 aa  179  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  34.84 
 
 
1776 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  33.67 
 
 
559 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  30.72 
 
 
6889 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  32.9 
 
 
568 aa  178  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  34.59 
 
 
1801 aa  176  7e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 
613 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  34.34 
 
 
4336 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  33.09 
 
 
4317 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  29.09 
 
 
7122 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  31.99 
 
 
4317 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  34.18 
 
 
4336 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  30.49 
 
 
3235 aa  172  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  32.66 
 
 
4317 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  33.5 
 
 
4332 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  35.35 
 
 
3208 aa  170  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 
595 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 
579 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  31.49 
 
 
4317 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  33.41 
 
 
609 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  28.89 
 
 
3099 aa  169  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  32.89 
 
 
1779 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  31.82 
 
 
585 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  34.67 
 
 
4318 aa  166  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 
593 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  28.82 
 
 
601 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  30.81 
 
 
3231 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4912  amino acid adenylation domain protein  35.03 
 
 
1715 aa  163  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.650159  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.27 
 
 
2762 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 
1272 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  29.91 
 
 
578 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 
534 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 
701 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  29.78 
 
 
2997 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11954  putative fatty-acid--CoA ligase  33.41 
 
 
620 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.607108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 
580 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0198968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1828  AMP-dependent synthetase and ligase  27.16 
 
 
576 aa  160  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.397575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>