More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32420 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  64.36 
 
 		 546 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 560 aa  1114    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.9 
 
 		 544 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0614831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.9 
 
 		 544 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.893245  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.52 
 
 		 563 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1935  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.08 
 
 		 544 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0140383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4640  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.08 
 
 		 544 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4798  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.08 
 
 		 544 aa  568  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1051  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.58 
 
 		 544 aa  556  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.94 
 
 		 544 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5617  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.03 
 
 		 544 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.99 
 
 		 544 aa  548  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.48 
 
 		 544 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.256075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5237  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.48 
 
 		 544 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0398716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.77 
 
 		 562 aa  332  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  33.27 
 
 		 936 aa  290  5.0000000000000004e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  36.95 
 
 		 1035 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  33.08 
 
 		 852 aa  288  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 		 958 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 942 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 		 949 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4411  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  34.67 
 
 		 528 aa  273  7e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1945  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  36.21 
 
 		 526 aa  269  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1770  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  34.96 
 
 		 524 aa  267  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0440023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1702  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  34.96 
 
 		 521 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1723  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  34.96 
 
 		 521 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  36.04 
 
 		 958 aa  266  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  35.35 
 
 		 962 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11375  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  36.14 
 
 		 521 aa  259  8e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.763989  normal  0.42524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2383  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  35.93 
 
 		 535 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.962951  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 947 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2342  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  35.93 
 
 		 535 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2389  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  35.93 
 
 		 535 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 		 584 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  38.5 
 
 		 653 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  34.35 
 
 		 577 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  33.01 
 
 		 3099 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 586 aa  240  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  33.15 
 
 		 2791 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 586 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  31.75 
 
 		 574 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 		 586 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  36.83 
 
 		 1067 aa  230  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  34.59 
 
 		 586 aa  230  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  32.89 
 
 		 576 aa  229  8e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  32.7 
 
 		 576 aa  229  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  33.08 
 
 		 573 aa  229  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  32.89 
 
 		 576 aa  228  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  33.08 
 
 		 573 aa  228  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  32.82 
 
 		 563 aa  228  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  34.68 
 
 		 601 aa  226  7e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  31.49 
 
 		 585 aa  226  8e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 839 aa  225  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5195  amino acid adenylation domain protein  34.22 
 
 		 2753 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.628302 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  36.73 
 
 		 568 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  34.94 
 
 		 2997 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  29.7 
 
 		 581 aa  221  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  36.64 
 
 		 592 aa  219  8.999999999999998e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  36.32 
 
 		 4317 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 		 614 aa  219  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  33.21 
 
 		 6403 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  29.96 
 
 		 581 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  36.23 
 
 		 4317 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  32.23 
 
 		 4317 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  37.95 
 
 		 578 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 596 aa  216  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  35.08 
 
 		 1801 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  39.12 
 
 		 1699 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  37.38 
 
 		 4342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  36.68 
 
 		 4342 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41238  predicted protein  33.49 
 
 		 738 aa  213  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  33.58 
 
 		 603 aa  213  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  36.25 
 
 		 1789 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  33.81 
 
 		 2762 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  36.39 
 
 		 4317 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  35.87 
 
 		 574 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  32.91 
 
 		 755 aa  210  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6493  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 600 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.679743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5637  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 600 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6002  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 600 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  37.91 
 
 		 613 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 701 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  33.03 
 
 		 1474 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  38.52 
 
 		 609 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  34.41 
 
 		 599 aa  208  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  33.09 
 
 		 586 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 		 580 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0198968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 		 706 aa  207  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  38.46 
 
 		 1779 aa  207  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  34.17 
 
 		 610 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  34.17 
 
 		 610 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  34.17 
 
 		 599 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  34.23 
 
 		 610 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  34.17 
 
 		 599 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7411  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 587 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.73 
 
 		 6889 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 599 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6150  AMP-dependent synthetase and ligase  34.47 
 
 		 594 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102681  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  33.99 
 
 		 7122 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 		 579 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>