More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0652 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  64.36 
 
 		 560 aa  672    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 546 aa  1075    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.76 
 
 		 544 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0614831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.76 
 
 		 544 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.893245  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.01 
 
 		 563 aa  570  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1935  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.04 
 
 		 544 aa  568  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0140383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4798  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.75 
 
 		 544 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4640  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.94 
 
 		 544 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1051  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.02 
 
 		 544 aa  549  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.03 
 
 		 544 aa  545  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.56 
 
 		 544 aa  544  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5617  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.03 
 
 		 544 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.66 
 
 		 544 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.256075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5237  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.66 
 
 		 544 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0398716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.91 
 
 		 562 aa  339  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  39.11 
 
 		 958 aa  306  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 		 942 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  37.92 
 
 		 949 aa  293  6e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4411  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  37.99 
 
 		 528 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  33.27 
 
 		 936 aa  289  1e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  32.88 
 
 		 852 aa  284  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 		 958 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 947 aa  274  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1945  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  35.24 
 
 		 526 aa  273  7e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  35.37 
 
 		 962 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1702  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  36.31 
 
 		 521 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1723  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  36.31 
 
 		 521 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1770  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  36.31 
 
 		 524 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0440023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  35.08 
 
 		 1035 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  37.77 
 
 		 586 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  31.15 
 
 		 3099 aa  262  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  38.12 
 
 		 586 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11375  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  36.61 
 
 		 521 aa  256  7e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.763989  normal  0.42524 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  36.74 
 
 		 586 aa  256  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  38.83 
 
 		 584 aa  253  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 586 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  32.49 
 
 		 576 aa  243  5e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  32.49 
 
 		 573 aa  243  5e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  32.76 
 
 		 563 aa  243  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  37.56 
 
 		 576 aa  242  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  37.56 
 
 		 576 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  37.31 
 
 		 573 aa  240  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  32.75 
 
 		 574 aa  240  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  33.63 
 
 		 601 aa  239  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  38.58 
 
 		 1789 aa  236  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2383  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  33.33 
 
 		 535 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.962951  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2342  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  33.33 
 
 		 535 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2389  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  33.33 
 
 		 535 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 577 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  37.59 
 
 		 4317 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  38 
 
 		 4317 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  40.97 
 
 		 1779 aa  231  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  37.75 
 
 		 4317 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 		 1272 aa  231  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  36.7 
 
 		 4317 aa  230  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 839 aa  226  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  36.64 
 
 		 701 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  33.09 
 
 		 568 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  38.64 
 
 		 1801 aa  225  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 		 613 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  37.23 
 
 		 603 aa  223  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  31.51 
 
 		 2791 aa  223  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  32.5 
 
 		 585 aa  223  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  33.21 
 
 		 755 aa  223  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  38.24 
 
 		 608 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 653 aa  220  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  38.5 
 
 		 1776 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  33.27 
 
 		 4336 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 		 1292 aa  217  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  36.52 
 
 		 4342 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  36.1 
 
 		 4332 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 		 586 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  36.53 
 
 		 610 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  37.47 
 
 		 609 aa  213  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  36.32 
 
 		 599 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  36.32 
 
 		 599 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  36.32 
 
 		 610 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  36.32 
 
 		 599 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5195  amino acid adenylation domain protein  29.24 
 
 		 2753 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.628302 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  36.53 
 
 		 610 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  36.87 
 
 		 3208 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  30.57 
 
 		 2997 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  37.16 
 
 		 4342 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  36.1 
 
 		 1474 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  38.54 
 
 		 4318 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5637  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 		 600 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6002  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 		 600 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.46 
 
 		 4336 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6493  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 		 600 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.679743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  32.65 
 
 		 4101 aa  207  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 1323 aa  206  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  32.02 
 
 		 574 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 648 aa  206  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  33.75 
 
 		 1067 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7411  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 		 587 aa  203  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  30.34 
 
 		 576 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  31.88 
 
 		 1291 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  27.46 
 
 		 581 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  31.88 
 
 		 1276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 561 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>