More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2951 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
577 aa  1155    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  39.53 
 
 
958 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  37.41 
 
 
958 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  33.63 
 
 
852 aa  319  7.999999999999999e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  33.45 
 
 
936 aa  315  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  37.61 
 
 
574 aa  314  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 
584 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  36.86 
 
 
585 aa  310  4e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 
603 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  34.87 
 
 
576 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 
942 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  34.87 
 
 
573 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 
947 aa  303  6.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  35.19 
 
 
563 aa  302  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  34.87 
 
 
576 aa  301  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  36.48 
 
 
949 aa  301  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  34.87 
 
 
573 aa  300  6e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  34.87 
 
 
576 aa  299  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 
839 aa  296  9e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  38.66 
 
 
586 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  35.99 
 
 
601 aa  295  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  34.48 
 
 
608 aa  293  5e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  39.6 
 
 
568 aa  293  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  32.04 
 
 
3099 aa  281  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 
962 aa  281  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 
586 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  36.98 
 
 
586 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  35.73 
 
 
1801 aa  270  4e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  37.18 
 
 
586 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.54 
 
 
2762 aa  266  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  36.4 
 
 
1789 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  35.24 
 
 
4332 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  35.86 
 
 
4317 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  34.78 
 
 
6403 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  35.73 
 
 
4342 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  36.21 
 
 
4336 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  35.98 
 
 
4317 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  38.35 
 
 
3235 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.9 
 
 
6889 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  35.98 
 
 
4342 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  31.63 
 
 
2997 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 
725 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 
592 aa  257  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 
725 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  32.47 
 
 
2820 aa  256  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.79 
 
 
563 aa  256  8e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  37.02 
 
 
1776 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  35.79 
 
 
4318 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.31 
 
 
562 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  35.41 
 
 
1035 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 
614 aa  255  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 
596 aa  255  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  34.6 
 
 
4336 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  34.93 
 
 
4317 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  35.61 
 
 
2250 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  33.52 
 
 
2791 aa  252  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  35.12 
 
 
4317 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12944  acyl-CoA synthetase  34.72 
 
 
626 aa  251  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  35.7 
 
 
574 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  32.59 
 
 
576 aa  249  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  35.59 
 
 
597 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  30.77 
 
 
581 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 
602 aa  248  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.46 
 
 
544 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0614831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.46 
 
 
544 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.893245  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 
597 aa  246  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 
597 aa  246  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  30.87 
 
 
581 aa  246  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2099  AMP-binding domain-containing protein  36.64 
 
 
622 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  32.28 
 
 
4101 aa  244  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 
579 aa  243  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 
595 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  34.01 
 
 
559 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  33.05 
 
 
1067 aa  242  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 
611 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  36.42 
 
 
1779 aa  240  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 
578 aa  239  8e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.7 
 
 
544 aa  239  8e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  33.27 
 
 
1656 aa  239  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 
1272 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  32.64 
 
 
619 aa  238  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.98 
 
 
546 aa  238  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  32.62 
 
 
1323 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.04 
 
 
560 aa  237  6e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0433  AMP-binding enzyme family protein  30.84 
 
 
559 aa  236  6e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  34.62 
 
 
3231 aa  236  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  32.25 
 
 
1291 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  32.25 
 
 
1276 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  32.25 
 
 
1283 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1754  acyl-CoA synthetase  30.84 
 
 
564 aa  236  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 
586 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3396  acyl-CoA synthetase  34.44 
 
 
592 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.733588  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2867  acyl-CoA synthetase  34.85 
 
 
580 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.70026  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  33.02 
 
 
601 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2836  acyl-CoA synthetase  34.72 
 
 
580 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  33.02 
 
 
601 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 
599 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2880  acyl-CoA synthetase  34.72 
 
 
631 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.894395  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  31.13 
 
 
583 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2414  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 
1818 aa  233  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>