More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2389 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2383  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  100 
 
 
535 aa  1061    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.962951  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1702  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  63.15 
 
 
521 aa  643    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11665  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1723  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  63.15 
 
 
521 aa  643    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2342  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  100 
 
 
535 aa  1061    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1770  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  63.48 
 
 
524 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0440023  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2389  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  100 
 
 
535 aa  1061    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265242  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1945  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  63.41 
 
 
526 aa  632  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4411  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  62.64 
 
 
528 aa  622  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11375  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  63.1 
 
 
521 aa  621  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.763989  normal  0.42524 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.74 
 
 
560 aa  251  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.02 
 
 
562 aa  249  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.98 
 
 
544 aa  242  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1051  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.59 
 
 
544 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5617  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.1 
 
 
544 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5237  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.1 
 
 
544 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0398716  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.1 
 
 
544 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.256075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 
546 aa  236  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.05 
 
 
563 aa  234  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1935  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 
544 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0140383  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 
544 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.893245  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 
544 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0614831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4798  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 
544 aa  230  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 
962 aa  229  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.08 
 
 
544 aa  229  8e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4640  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 
544 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  30.91 
 
 
936 aa  219  7.999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  30.73 
 
 
852 aa  218  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6493  AMP-dependent synthetase and ligase  34.07 
 
 
600 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.679743  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7411  AMP-dependent synthetase and ligase  37.97 
 
 
587 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5637  AMP-dependent synthetase and ligase  37.75 
 
 
600 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6002  AMP-dependent synthetase and ligase  37.75 
 
 
600 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  36.17 
 
 
949 aa  203  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  36.67 
 
 
1035 aa  201  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  30.77 
 
 
563 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6150  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 
594 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102681  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  30.43 
 
 
573 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  30.43 
 
 
576 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  32.06 
 
 
576 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  30.74 
 
 
576 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  35.35 
 
 
1699 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 
958 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  30.92 
 
 
573 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 
942 aa  193  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  32.23 
 
 
608 aa  192  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 
586 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 
947 aa  192  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 
577 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 
958 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 
653 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  36.08 
 
 
1801 aa  189  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0531  AMP-binding domain-containing protein  31.94 
 
 
635 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.612015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0549  AMP-binding domain-containing protein  31.94 
 
 
588 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 
839 aa  186  8e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0718  AMP-binding domain-containing protein  31.74 
 
 
686 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0642699  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 
586 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 
586 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3166  AMP-binding domain-containing protein  31.74 
 
 
588 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1452  AMP-binding domain-containing protein  31.74 
 
 
577 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2880  AMP-binding domain-containing protein  31.74 
 
 
577 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0136  AMP-binding domain-containing protein  31.74 
 
 
577 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  31.51 
 
 
568 aa  183  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 
603 aa  182  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 
586 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  31.9 
 
 
4332 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  33.17 
 
 
4317 aa  180  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  30.53 
 
 
585 aa  179  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  35.75 
 
 
1789 aa  179  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  29.89 
 
 
584 aa  179  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  30.63 
 
 
3235 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 
613 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 
648 aa  178  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  29.74 
 
 
755 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  33 
 
 
4317 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  32.01 
 
 
4317 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  36.21 
 
 
3208 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  31.38 
 
 
601 aa  176  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  35.87 
 
 
3235 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  34.26 
 
 
1776 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  34.5 
 
 
4342 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  31.82 
 
 
4317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  30.62 
 
 
2997 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  29.1 
 
 
6889 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  29.28 
 
 
574 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  34.44 
 
 
4336 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  33.82 
 
 
1981 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  29.45 
 
 
2820 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1828  AMP-dependent synthetase and ligase  25.48 
 
 
576 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.397575  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  34.41 
 
 
4342 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  36.21 
 
 
4318 aa  170  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  33.16 
 
 
579 aa  169  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  33.74 
 
 
1753 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  27.81 
 
 
7122 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  27.67 
 
 
3099 aa  169  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  35.61 
 
 
1779 aa  169  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  33.57 
 
 
4336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  30.25 
 
 
1291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  30.25 
 
 
1276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  30.27 
 
 
588 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  30.37 
 
 
573 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  29.57 
 
 
3718 aa  167  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>