More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3442 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  98.26 
 
 
576 aa  1172    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  98.58 
 
 
563 aa  1145    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  98.25 
 
 
573 aa  1165    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  98.6 
 
 
573 aa  1170    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  98.78 
 
 
576 aa  1180    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
576 aa  1193    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  47.06 
 
 
584 aa  527  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  46.01 
 
 
608 aa  504  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  47.67 
 
 
603 aa  504  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  48.45 
 
 
601 aa  498  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  45.14 
 
 
839 aa  463  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  43.32 
 
 
574 aa  463  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  44.23 
 
 
568 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  43.17 
 
 
585 aa  428  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 
958 aa  316  7e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  37.61 
 
 
1776 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  35.47 
 
 
947 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  36.89 
 
 
1801 aa  294  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  33.9 
 
 
942 aa  294  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 
577 aa  292  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 
949 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  37.57 
 
 
3208 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 
586 aa  289  9e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  36.38 
 
 
4317 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  34.8 
 
 
852 aa  287  4e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  34.8 
 
 
936 aa  285  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  36.98 
 
 
958 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  35.98 
 
 
1779 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 
586 aa  284  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  35.33 
 
 
4317 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  37.01 
 
 
4342 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  35.07 
 
 
4317 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  34.43 
 
 
2997 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 
962 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  36.94 
 
 
4342 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  35.8 
 
 
4336 aa  280  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  35.27 
 
 
1656 aa  280  6e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  35.81 
 
 
4317 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 
586 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  35.87 
 
 
4336 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  34.83 
 
 
4332 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  35.28 
 
 
1789 aa  278  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  34.27 
 
 
2250 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  36.23 
 
 
559 aa  272  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 
586 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  35.37 
 
 
578 aa  270  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.43 
 
 
2762 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  34.37 
 
 
3235 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  34.72 
 
 
2820 aa  264  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  34.45 
 
 
6403 aa  263  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  32.96 
 
 
1067 aa  261  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  34.25 
 
 
4318 aa  259  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 
614 aa  259  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  33.82 
 
 
579 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  31.05 
 
 
581 aa  257  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  34.72 
 
 
1981 aa  258  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  31.05 
 
 
581 aa  256  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  34.38 
 
 
2791 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 
725 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 
611 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  33.96 
 
 
3231 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 
725 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  32.25 
 
 
3099 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  33.03 
 
 
608 aa  252  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  33.03 
 
 
595 aa  251  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 
586 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 
991 aa  250  5e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  33.15 
 
 
1474 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 
653 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 
599 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 
597 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  32.96 
 
 
1035 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1754  acyl-CoA synthetase  30.05 
 
 
564 aa  246  8e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 
597 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0433  AMP-binding enzyme family protein  30.71 
 
 
559 aa  246  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2099  AMP-binding domain-containing protein  36.16 
 
 
622 aa  243  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335161  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 
592 aa  243  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  33.89 
 
 
602 aa  243  9e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  34.87 
 
 
1276 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  34.87 
 
 
1291 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  34.87 
 
 
1283 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.56 
 
 
546 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 
596 aa  241  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 
1272 aa  240  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  33.83 
 
 
755 aa  240  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  33.03 
 
 
617 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  33.03 
 
 
617 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  33.03 
 
 
617 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  31.06 
 
 
1753 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.5 
 
 
563 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  34.3 
 
 
1323 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18360  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.96 
 
 
577 aa  237  6e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1849  AMP-binding domain-containing protein  36.84 
 
 
621 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0427  AMP-binding enzyme  36.84 
 
 
621 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0523  AMP-binding enzyme  36.62 
 
 
621 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.746199  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.2 
 
 
629 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  32.56 
 
 
606 aa  233  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  29.66 
 
 
3235 aa  232  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.68 
 
 
629 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  33.59 
 
 
2721 aa  232  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>