More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2109 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  48.9 
 
 
2103 aa  641    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  49.34 
 
 
2791 aa  644    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  52.14 
 
 
1656 aa  726    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  52.02 
 
 
725 aa  664    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  51.87 
 
 
725 aa  663    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
991 aa  2041    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  52.01 
 
 
2762 aa  699    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  48.8 
 
 
2997 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  51.16 
 
 
611 aa  622  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  50.96 
 
 
596 aa  587  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  48.85 
 
 
614 aa  572  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  46.65 
 
 
602 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  42.08 
 
 
1067 aa  531  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  45.04 
 
 
597 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  45.04 
 
 
597 aa  515  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  38.8 
 
 
1474 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  45.94 
 
 
586 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  42.75 
 
 
6403 aa  500  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  40.38 
 
 
2250 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  40.28 
 
 
2820 aa  468  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  42.31 
 
 
592 aa  469  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  40.77 
 
 
588 aa  469  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  42.61 
 
 
581 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  42.43 
 
 
581 aa  455  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  37.41 
 
 
2721 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  40.5 
 
 
579 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  37.74 
 
 
6889 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  37.22 
 
 
706 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  35.93 
 
 
755 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  40.35 
 
 
595 aa  429  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.34 
 
 
4336 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  36.39 
 
 
4317 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  41.05 
 
 
4332 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  36.18 
 
 
4342 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  36.54 
 
 
4342 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  37.63 
 
 
617 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  37.37 
 
 
617 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  37.37 
 
 
617 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  35.5 
 
 
4317 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  35.41 
 
 
1801 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  35.2 
 
 
4317 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  36.11 
 
 
4336 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0276  AMP-binding domain-containing protein  36.7 
 
 
620 aa  406  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  37.22 
 
 
4318 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 
578 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  40.36 
 
 
608 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  36.43 
 
 
4317 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  38.82 
 
 
1323 aa  392  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  39.23 
 
 
1283 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  39.23 
 
 
1291 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  39.25 
 
 
1276 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  34.28 
 
 
3235 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
599 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  38.7 
 
 
610 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
599 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  37.54 
 
 
597 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
610 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  35.8 
 
 
1753 aa  376  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
610 aa  376  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  38.7 
 
 
599 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  36.92 
 
 
1272 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 
593 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 
701 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 
599 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.24 
 
 
629 aa  366  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  36.91 
 
 
1789 aa  360  6e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  37.06 
 
 
574 aa  360  9e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  35.18 
 
 
3231 aa  360  9e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 
1292 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.57 
 
 
629 aa  356  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  34.53 
 
 
1776 aa  355  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  36.41 
 
 
609 aa  354  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  35.27 
 
 
1779 aa  353  7e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  37.23 
 
 
559 aa  350  6e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1754  acyl-CoA synthetase  35.49 
 
 
564 aa  348  3e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0433  AMP-binding enzyme family protein  35.49 
 
 
559 aa  348  3e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.71 
 
 
629 aa  346  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.71 
 
 
629 aa  346  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.71 
 
 
629 aa  346  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  35.51 
 
 
606 aa  345  4e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  33.38 
 
 
6274 aa  340  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  32.45 
 
 
1981 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  33.38 
 
 
6272 aa  340  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  33.38 
 
 
6271 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41238  predicted protein  32.85 
 
 
738 aa  338  3.9999999999999995e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 
582 aa  337  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13835  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.41 
 
 
637 aa  336  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331415  normal  0.284181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 
555 aa  336  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 
640 aa  333  7.000000000000001e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.541656  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2099  AMP-binding domain-containing protein  36.51 
 
 
622 aa  330  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335161  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 
636 aa  330  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  31.54 
 
 
4268 aa  329  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  32.64 
 
 
593 aa  327  8.000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  35.2 
 
 
573 aa  325  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3072  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 
684 aa  324  5e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.839841  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  34.7 
 
 
578 aa  323  7e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  35.64 
 
 
1699 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1588  AMP-binding domain-containing protein  35.58 
 
 
605 aa  321  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2901  putative fatty-acid--CoA ligase  34.74 
 
 
593 aa  321  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650918  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1670  AMP-binding domain-containing protein  35.58 
 
 
605 aa  321  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>