More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3074 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 603 aa  1229    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  56.34 
 
 		 584 aa  651    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  51.13 
 
 		 608 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  49.74 
 
 		 601 aa  522  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  47.49 
 
 		 576 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  47.49 
 
 		 573 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  47.67 
 
 		 576 aa  504  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  47.49 
 
 		 573 aa  500  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  47.31 
 
 		 576 aa  502  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  47.22 
 
 		 563 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  47.87 
 
 		 568 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  44.58 
 
 		 574 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  44.85 
 
 		 585 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  44.62 
 
 		 839 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  36.3 
 
 		 852 aa  314  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  36.13 
 
 		 936 aa  309  8e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  36.82 
 
 		 958 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  36.55 
 
 		 577 aa  299  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  39.06 
 
 		 949 aa  296  8e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  38.4 
 
 		 958 aa  292  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 947 aa  290  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 		 942 aa  283  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  36.33 
 
 		 1801 aa  281  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 586 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  35.94 
 
 		 586 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 		 586 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  37.85 
 
 		 4318 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  36.77 
 
 		 4317 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  34.76 
 
 		 1779 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  33.74 
 
 		 1656 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  33.64 
 
 		 2997 aa  267  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  34.16 
 
 		 962 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  36.77 
 
 		 4317 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  35.73 
 
 		 3231 aa  266  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.24 
 
 		 2762 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  33.69 
 
 		 4332 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  34.03 
 
 		 1789 aa  264  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  33.8 
 
 		 1067 aa  263  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  35.6 
 
 		 3208 aa  263  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  36.26 
 
 		 4317 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  36.74 
 
 		 586 aa  263  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  33.63 
 
 		 595 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  34.9 
 
 		 4317 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  34.46 
 
 		 4336 aa  257  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  34.05 
 
 		 4342 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  35.42 
 
 		 2820 aa  256  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  34.95 
 
 		 1035 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  33.75 
 
 		 4342 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  34.64 
 
 		 3235 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  34.95 
 
 		 1776 aa  255  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 		 725 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 		 725 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  34.34 
 
 		 4336 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 		 578 aa  251  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  35.24 
 
 		 2250 aa  250  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 		 653 aa  249  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3404  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 		 551 aa  247  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.469336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 586 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 614 aa  243  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  31.61 
 
 		 6403 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  33.94 
 
 		 610 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  32.87 
 
 		 1474 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  31.32 
 
 		 1753 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  33.94 
 
 		 610 aa  240  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  33.94 
 
 		 599 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  33.94 
 
 		 599 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 		 579 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  33.76 
 
 		 599 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  33.76 
 
 		 610 aa  237  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 		 701 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  31.34 
 
 		 2791 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 		 597 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 611 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  33.74 
 
 		 599 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 		 597 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  31.27 
 
 		 593 aa  233  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 592 aa  232  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 		 596 aa  232  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1754  acyl-CoA synthetase  31.31 
 
 		 564 aa  230  5e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0433  AMP-binding enzyme family protein  31.31 
 
 		 559 aa  229  8e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  32.96 
 
 		 2721 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  33.87 
 
 		 609 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 		 602 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.93 
 
 		 563 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  28.92 
 
 		 588 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 597 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  31.53 
 
 		 6889 aa  225  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5195  amino acid adenylation domain protein  30.7 
 
 		 2753 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.628302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 		 706 aa  223  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4912  amino acid adenylation domain protein  35.63 
 
 		 1715 aa  223  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.650159  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.23 
 
 		 546 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2049  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 547 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.998714  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41238  predicted protein  32.18 
 
 		 738 aa  221  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  31.38 
 
 		 559 aa  221  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18360  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.6 
 
 		 577 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  32.98 
 
 		 1981 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  29.07 
 
 		 3718 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  28.98 
 
 		 7122 aa  220  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.04 
 
 		 562 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  29.8 
 
 		 3099 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>